Análisis de secuencias de la envoltura y de genomas completos de virus de un cluster de VIH-1 de subtipo f de rápida expansión en Galicia: predicción de uso de correceptores y filogenia

• Domínguez Palao, F. ^[1] ; Vega, Y. ^[1] ; Delgado, E. ^[1] ; Pérez Álvarez, L. ^[1] ; Thomson Okatsu, M. ^[1]
  1. [1] Instituto de Salud Carlos III

     Instituto de Salud Carlos III

     Madrid, España

     
• Localización: Revista complutense de ciencias veterinarias, ISSN 1988-2688, Vol. 6, Nº. 2, 2012, págs. 19-37
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Analysis of both the envelope sequence and the complete genome of a hiv-1 subtype f cluster of rapid expansion in galicia: coreceptor use prediction and phylogeny
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• Resumen
  • español

    La epidemia por VIH-1 en España, al igual que en el resto de Europa occidental, está dominada por el subtipo B. Sin embargo, recientemente se ha descrito la rápida expansión de un cluster de subsubtipo F1 entre hombres que tienen relaciones sexuales con hombres en Galicia. Los objetivos de este trabajo son analizar la secuencia de la envoltura de los virus del mencionado cluster para predicción de utilización de correceptores y presencia de aminoácidos característicos, así como caracterizar secuencias de genomas completos, determinando las relaciones filogenéticas con virus de subtipo F de otros países. Los análisis filogenéticos permitieron determinar relaciones del cluster F con virus de Brasil, Suiza, Bélgica, Francia y Gran Bretaña. Por otra parte, se han encontrado posiciones características del cluster en la región V3, diferentes de otras cepas F1, así como en otras regiones de la envoltura. Aparte, se han identificado mutaciones características asociadas a tropismo X4. El cluster de VIH-1 de subtipo F recientemente expandido en Galicia procede de una variante ampliamente diseminada en Europa occidental. Los virus de dicho cluster presentan aminoácidos característicos en la envoltura, identificándose en algunos de ellos mutaciones asociadas a tropismo X4, de potencial relevancia biológica.

  • English

    The HIV-1 epidemic in Spain, as in the rest of Western Europe, is dominated by subtype B. However, it has recently been reported that a subsubtype F1 cluster has rapidly expanded among men who have sex with men in Galicia. The objectives of this work are to analyze the virus envelope sequence of the aforementioned cluster to predict the use of coreceptors and to examine the presence of characteristic amino acids, as well as to characterize full-length genome sequences, determining the phylogenetic relations with subtype F viruses from other countries. The phylogenetic analyses allowed to determine the relation of the Galician F cluster with viruses from Brazil, Switzerland, Belgium, France and Great Britain. On the other hand, characteristic amino acid residues were found in the V3 loop of viruses of the cluster, differing from other F1 strains, as well as in other regions of the envelope. Additionally, characteristic mutations associated with X4 tropism were identified. The HIV-1 subtype F cluster recently expanded in Galicia derives from a variant widely disseminated in Western Europe. The viruses of the mentioned cluster show characteristic amino acids in the envelope, with mutations associated with X4 tropism having been identified in some of them, which are of potential biological relevance.