Selección Bacterias fluorescentes productoras de metabolitos antagónicos de cultivares nativos de Musa sp. y su diversidad filogenética al gen ARNr 16S

• Chávez-Arteaga, Karen Tatiana ^[2] ; Guato-Molina, Jefferson Javier ^[3] ; Peñafiel-Jaramillo, María Fernanda ^[1] ; Mestanza-Uquillas, Camilo Alexander ^[1] ; Martínez, Hayron Fabricio Canchignia ^[1]
  1. [1] Universidad Técnica Estatal de Quevedo

     Universidad Técnica Estatal de Quevedo

     Quevedo, Ecuador

     
  2. [2] Departamento Bionintanga, NINTANGA S.A
  3. [3] Fincas Experimentales Nestlé, R&D. Tours, Quevedo

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• Localización: Revista Ciencia y Tecnología, ISSN-e 1390-4043, ISSN 1390-4051, Vol. 11, Nº. 2, 2018, págs. 17-29
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Fluorescent bacteria producers of metabolitos antagónicos de cultivares nativos de Musa sp. and their phylogenetic diversity the 16S rRNA gene
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• Resumen
  • español

    El objetivo del trabajo se enfocó en identificar bacterias fluorescentes productoras de metabolitos secundarios antagónicos y analizar su biodiversidad al gen ARNr 16S. Las bacterias se aislaron de cultivares nativos de Musa de las provincias: Los Ríos, Cotopaxi y Bolívar. El escrutinio de las cepas antagónicas se basó en la actividad proteolítica y la amplificación de genes antifúngicos. Además, se realizó el análisis filogenético al ARN ribosomal 16S por análisis de restricción ARDRA y secuenciación. Desde rizósfera de siete cultivares nativos de Musa se rescató y seleccionó 16 cepas nativas con emisión fluorescente, observando la actividad proteasa (PR) para las cepas (PB3-6, BO3-4, BA4-19, PM3-8 y PM3-14). Verificando por PCR la presencia del gen hcnABC (HCN) de 570 pb en las cepas (PB3-6, BO3-4, PM3-8 y PM3-14) y pirrolnitrina (Prn) de 786 pb en las cepas (BMR2-2, BMR2-4, BMR2-12, BO3-4 y PM3-14). Los perfiles genéticos por ARDRA agruparon las cepas nativas de Musa productoras a PR, Prn y HCN (BMR2-2, BMR2-12, PB3-6, BO3-4, BA4-19, PM3-8 y PM3-14). La caracterización molecular por secuenciación del gen ARNr 16S, se verificaron los géneros: Serratia, Pseudomonas, Acinetobacter, Enterobacter y Klebsiella. Considerando siete cepas de bacterias candidatas de actividad antagónica que servirán para la continuidad de la investigación al efecto positivo en incremento de biomasa en plantaciones de banano y efecto bio-controlador a Mycosphaerella fijiensis.

  • English

    The objective of the work was to identify fluorescent bacteria producing antagonistic secondary metabolites and analyze their biodiversity to the 16S rRNA gene. The bacteria were isolated from native Musa cultivars of the provinces: Los Ríos, Cotopaxi and Bolívar. The screening of the antagonistic strains was based on the proteolytic activity and the amplification of antifungal genes. Further, phylogenetic analysis was performed on 16S ribosomal RNA by ARDRA restriction analysis and sequencing. From the rhizosphere of seven native Musa cultivars, 16 native strains with fluorescent emission were rescued and selected, observing the protease activity (PR) for the strains (PB3-6, BO3-4, BA4-19, PM3-8 and PM3-14). Verifying by PCR the presence of the hcnABC gene (HCN) of 570 bp in the strains (PB3-6, BO3-4, PM3-8 and PM3-14) and pyrrolnitrine (Prn) of 786 bp in the strains (BMR2-2, BMR2-4, BMR2-12, BO3-4 and PM3-14). The genetic profiles by ARDRA grouped the native strains of Musa producers to PR, Prn and HCN (BMR2-2, BMR2-12, PB3-6, BO3-4, BA4-19, PM3-8 and PM3-14). The molecular characterization by sequencing of the 16S rRNA gene, the genera were verified: Serratia, Pseudomonas, Acinetobacter, Enterobacter and Klebsiella. Considering seven strains of candidate bacteria of antagonistic activity that will serve for the continuity of the research to the positive effect in increase of biomass in banana plantations and biocontrol effect to Mycosphaerella fijiensis.