Resumen de Bacterial microbiota composition of fermented fruit and vegetable juices (jiaosu) analyzed by single-molecule, real-time (SMRT) sequencing
Da Ma, Qiuwen He, Jia Ding, Huiyan Wang, Heping Zhang, Lai‐Yu Kwok
- español
Recientemente, en Asia han ganado popularidad los jiaosu (jugos fermentados de fruta y verduras) preparados en forma comercial. Al igual que otros productos fermentados, éstos contienen una elevada diversidad y riqueza microbiana. Sin embargo, no existen estudios publicados que describan su composición microbiótica. Por ello, el presente estudio se propuso obtener los perfiles completos de 16S rRNA de jiaosu, utilizando tecnología de secuenciación a tiempo real de una sola molécula. Esta metodología permitió obtener la microbiota bacteriana de tres productos jiaosu adquiridos en Taiwán y Japón e identificar las secuencias bacterianas de las tres muestras distribuidas en siete filos diferentes, principalmente proteobacteria, firmicutes, actinobacteria y bacteroidetes. Se registraron 43 géneros (esto es, Ochrobactrum, Lactobacillus, Mycobacterium y Acinetobacter) y 55 especies (Ochrobactrum lupini, Mycobacterium abscessus, Acinetobacter johnsonii, Lactobacillus paracasei, Lactobacillus delbrueckii y Petrobacter succinatimandens). Por otra parte, en todo el conjunto de datos no se identificó ninguna secuencia patógena. Además, solo en una proporción reducida de secuencias se detectó la microflora común de la piel y el indicador de higiene alimentaria Escherichia/Shigella; ello sugiere que se trabajó en aceptables condiciones higiénicas generales durante el proceso de manufactura.
- English
Commercially manufactured ‘jiaosu’ (fermented fruit and vegetable juices) have gained popularity in Asia recently. Like other fermented products, they have a high microbial diversity and richness. However, no published study has yet described their microbiota composition. Thus, this work aimed to obtain the full-length 16S rRNA profiles of jiaosu using the PacBio single-molecule, real-time sequencing technology. We described the bacterial microbiota of three jiaosu products purchased from Taiwan and Japan. Bacterial sequences from all three samples distributed across seven different phyla, mainly Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria, and Bacteroidetes. Forty-three genera were identified (e.g. Ochrobactrum, Lactobacillus, Mycobacterium, and Acinetobacter). Fifty-five species were identified (e.g. Ochrobactrum lupini, Mycobacterium abscessus, Acinetobacter johnsonii, Lactobacillus paracasei, Lactobacillus delbrueckii, and Petrobacter succinatimandens). No pathogen sequences were identified within the entire dataset. Moreover, only a low proportion of sequences represented common skin microflora and the food hygiene indicator Escherichia/Shigella, suggesting overall acceptable sanitary conditions during the manufacturing process.
