Variabilidad genética del cerdo Congo Santandereano mediante marcadores microsatelite

• Jiménez, Á.P. ^[1] ; Albarracín, M. ^[2] ; Estupiñán, S. ^[1]
  1. [1] Universidade Federal de Pelotas

     Universidade Federal de Pelotas

     Brasil

     
  2. [2] Instituto Federal Farroupilha. Campus Alegrete. Brasil.
• Localización: Archivos de zootecnia, ISSN-e 1885-4494, ISSN 0004-0592, Vol. 66, Nº 256, 2017, págs. 597-602
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Genetic variability of Congo pig using microsatellite markers
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    El cerdo Congo Santandereano es un recurso zoogenético de importancia para la seguridad alimentaria y la economía campesina propio del departamento de Santander, Colombia. Se determinó su variabilidad genética mediante la genotipificación de 12 marcadores microsatélite, reportados por la FAO y la ISAG. Se recolectaron 37 muestras de sangre porcina. El ADN fue extraído mediante el kit DNA 2000 de Corpogen®, y cuantificado por fluorometria (Qubit Fluorometer Invitrogen®). Los microsatélites se amplificaron mediante PCR simple, para la genotipificación se sometieron los amplificados a electroforesis en cámara vertical en geles de poliacrilamida. Mediante el programa Genetix® se calculó la heterocigosidad observada (Ho) y esperada (He), el número de alelos para cada locus, las frecuencias alélicas y el coeficiente de endogamia Fis; con la herramienta Toolkit microssatélite de Excel® se calcularon los índices polimórficos (PIC). Los 12 microsatélites resultaron polimórficos y se detectó un total de 52 alelos. El número medio de alelos encontrado en el cerdo Congo fue de 4,3. La He varió entre un mínimo de 0,42 para los marcadores S009 y SW240 y un máximo de 0,76 para el marcador CGA1. La heterocigosidad media observada fue de 0,35, la mayoría de los marcadores utilizados resultaron muy informativos de variabilidad genética con valores de PIC superiores a 0,5. El índice de endogamia (FIS 0,5) revela un alto déficit de heterocigotos . Estos hallazgos sugieren baja variabilidad genética del cerdo Congo, con una tendencia al incremento de consaguinidad, posiblemente relacionada con un tamaño poblacional reducido.

  • English

    The Congo pig is a zoogenetic resource characteristic of the Santander Department in Colombia. Its genetic diversity was evaluated using 12 different microsatellites, from 37 blood samples. DNA was extracted using Corpogen 2000 kit®; the microsatellites were amplified using PCR (Polymerase Chain Reaction) and electrophoresis of vertical chamber for typification. Using software (Genetix®) the observed heterozygosity (Ho) and expected heterozygosity (He), the number of alleles for each locus, the allelic frequency and the FIS statistics were calculated. The polymorphic indices (PIC) were calculated using the microsatellite excel Toolkit. The twelve microsatellites employed were polymorphic, a total of 52 alleles were detected, with a median of 4.3 alleles. The (He) range interval values was 0.42 (minimal markers S009 and SW240) – 0.76 (Maximal marker CGA1). The medium Ho was 35%, the majority of the markers were useful with polymorphism information content (PIC) superior to 0.5. The inbreeding index (FIS 0.5) reveals a high deficit of heterozygotes. This finding strongly suggests a low genetic variability of the Santander Congo pig, suggests a possible trend of increase in consanguinity, possibly related to a reduced population size.