Resumen de Estudio comparativo de la diversidad genética de Mycobacterium tuberculosis complex mediante análisis de polimorfismo de longitud de fragmentos amplificados y número variable de repeticiones en tándem de unidades repetitivas interespaciadas de micobact

Ana Patricia Jimenez Arias, María José Lahiguera, Rafael Borrás Salvador, Concepción Gimeno Cardona, Marcelo Grijalva Silva, María José Vallejo, M. del Remedio Guna Serrano

• español

  Las especies dentro del complejo Mycobacterium tuberculosis (MTB) son genéticamente monomórficas, por lo tanto existe una gran  necesidad de métodos confiables de genotipificación para la comprensión de la epidemiologia de esta enfermedad. Esta investigación evalúa la diversidad genética de una colección española de ochenta y tres aislados mediante el uso de polimorfismo de  longitud de  fragmentos amplificados (AFLP) y número variable de repeticiones en tándem de unidades repetitivas interespaciadas (15-loci MIRU-VNTR). Los resultados obtenidos mostraron 7 patrones de AFLP (P1-P7) cuyos coeficientes de Dice fueron: 71% para P1 vs P7 y 96% para P1 vs P2 y P2 vs P4. MIRU-VNTR demostró 25 patrones únicos y 14 clusters. Los linajes encontrados fueron: Haarlem (23, 36.51%), Cammeroon (2, 3.17%), LAM (12, 19.05%), West African (6, 9.52%) y EAI (1, 1.59%). Los índices de discriminación para AFLP fueron de 0.61 y  0.92 para MIRU-VNTR. En conclusión, este estudio demostró que MIRU-VNTRes robusto y reproducible para genotificar MTB. Adicionalmente, AFLP simplificado es relativamente sencillo de realizar y puede ser útil en el análisis de aislados con recursos limitados

• English

  Species within the Mycobacterium tuberculosis (MTB) Complex are genetically monomorphic, hence the need of genotyping methods for a comprehensive understanding of the epidemiology of the disease. The genetic diversity of a Spain collection of eighty-three, GenoType MTBC® -confirmed Mycobacterium tuberculosis clinical isolates was assessed by simplified AFLP and 15-loci MIRU-VNTR. AFLP results showed 7 patterns (P1-P7), Dice´s coefficient was 71% for P1 vs P7 and 96% for P1 vs P2 and P2 vs P4. MIRU-VNTR showed 25 unique patterns and 14 clusters. Lineages found were as follows: Haarlem (23, 36.51%), Cammeroon (2, 3.17%), LAM (12, 19.05%), West African (6, 9.52%) and EAI (1, 1.59%). Discrimination indexes were 0.61 for AFLP and 0.92 for MIRU-VNTR. In conclusion,  MIRU-VNTR is robust and reproducible for MTB genotyping. Simplified AFLP is a relatively easy-to-perform approach that might be useful for screening of isolates or in low resource settings.