Diversidad genética de aislamientos de phytophthora infestans en plantaciones de papa en Costa Rica con el uso de RAPDs

• Oswaldo Páez ^[1] ; Roberto Valverde ^[1] ; Luis Gómez ^[1] ; Arturo Brenes ^[1]
  1. [1] Universidad de Costa Rica

     Universidad de Costa Rica

     Hospital, Costa Rica

     
• Localización: Agronomía costarricense: Revista de ciencias agrícolas, ISSN-e 2215-2202, ISSN 0377-9424, Vol. 29, Nº. 1, 2005, págs. 41-55
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Genetic diversity of Phytophthora infestans isolates collected in potato fields of Costa Rica using RAPDs
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    Para determinar la diversidad genética de Phytophthora infestans en Costa Rica, 62 aislamientos de este patógeno fueron recolectados en plantaciones de papa en las zonas de Cartago, Zarcero, Fraijanes y Heredia durante 1999-2001 y analizados con el uso de RAPDs. Todos los aislamientos fueron previamente evaluados para el tipo de apareamiento y la resistencia al metalaxyl. Se seleccionó 11 imprimadores con los cuales fue posible formar 17 grupos RAPD cuyas frecuencias variaron de 0,55 a 0,02. En el grupo más frecuente se encontró aislamientos resistentes y sensibles provenientes de todas las zonas muestreadas. Todos los aislamientos en los 17 grupos mostraron una alta relación genética.

    La mayor diversidad genética se encontró entre aislamientos y no se observó ninguna sub-estructuración poblacional de acuerdo a las zonas o sensibilidad al metalaxyl. Al comparar los aislamientos costarricenses con los aislamientos forá- neos US-1, US-18 y EC-1, no se observó ninguna relación genética entre ambas poblaciones; de hecho, el coeficiente de diferenciación genética Gst mostró que la población local es diferente a la de los aislamientos foráneos. El análisis con los RAPDs reveló que la población de P. infestans, en las plantaciones de papa en Costa Rica, es diversa aunque probablemente los aislamientos comparten un ancestro en común.

  • English

    In order to determine the genetic diversity of Phytophthora infestans in Costa Rica, a total of 62 isolates were collected in potato-growing regions of Cartago, Zarcero, Heredia and Fraijanes during 1999-2001 and subjected to a RAPD analysis. All isolates were previously assayed for mating type and metalaxyl resistance. By using 11 primers, it was possible to generate 17 RAPD genotypes, with frequencies ranging from 0.55 to 0.02. Resistant and susceptible isolates coming from all sampled zones were found in the most frequent group.

    All isolates from the 17 groups showed a genetic relationship. The highest genetic variation was found among isolates; therefore, the population structure was not fractioned as a result of the production zone or the sensitivity to metalaxyl.

    Analyses with the Gst coefficient showed no genetic similarities between Costa Rican and the foreign (US-1, US-18, and EC-1) isolates. In conclusion, RAPD analysis revealed the genetic diversity of the P. infestans population in Costa Rican potato fields, although there is a possibility that all isolates are sharing a common ancestor