ISSR analysis of genetic diversity and relationships among sweet potato ("Ipomoea batatas") landraces in China

• Autores: Xue-qin He, Qing-chang Liu, Koshun Ishiki, Hong Zhai, Yu-ping Wang
• Localización: Plant Genetic Resources Newsletter = Bulletin de Ressources Phytogénétiques = Noticiario de Recursos Fitogenéticos, ISSN 1020-3362, Nº. 150, 2007, págs. 35-41
• Idioma: inglés
• Títulos paralelos:
  • Análisis ISSR de la diversidad genética y relaciones entre variedades locales de batata ("Ipomoea batatas") de China
  • Analyse ISSR de la diversité génétique et relations entre variétés locales de patate douce ("Ipomoea batatas") en Chine
• Enlaces
  • Texto Completo Ejemplar
• Resumen
  • español

    Se evaluaron ocho cultivares y cien variedades locales de batatas de seis regiones geográficas de China empleando secuencias entre repeticiones simples (ISSR, sigla en inglés) para analizar la diversidad genética y las relaciones entre unos y otras. Catorce primeres ISSR generaron 239 bandas polimórficas con un promedio de 17 bandas polimórficas por primer. Se halló una serie amplia de variaciones y una elevada distancia genética promedio entre las variedades locales de China, que se vinculaban también lejanamente con los cultivares con una distancia genética promedio de 0,6428 (serie de 0,2591 a 1,6428). El dendrograma UPGMA mostró la misma relación genética entre los cultivares, concordante con su origen conocido, y una muy amplia diversidad genética en las variedades locales chinas. El análisis de conglomerados clasificó los materiales en dos bloques, uno principal y uno menor. El grupo menor comprendía 14 variedades locales recogidas sobre todo en Guangdong y Fujian, y dos cultivares (cv. Nancy Hall y cv. Xu78-1) lejanamente vinculados entre sí. El bloque principal comprendía las otras 92 accesiones. Estos resultados indican que las variedades locales chinas de batatas no solo presentan un alto nivel de diversidad genética, sino que tienen diferentes antecedentes genéticos respecto de los cultivares.

  • English

    To analyse the genetic diversity and relationships among Chinese sweet potato landraces and cultivars in China, one hundred landraces from six geographical regions of China and eight cultivars were assessed using inter-simple sequence repeat (ISSR) markers. Fourteen ISSR primers generated 239 polymorphic bands with an average of 17 polymorphic bands per primer. A high average genetic distance and wide variation range were found among Chinese landraces, which were also distantly related to the cultivars with an average genetic distance of 0.6428 (range 0.2591 to 1.6428). The UPGMA dendrogram showed the same genetic relationship among the cultivars in agreement with their known origin and the very wide genetic diversity of the Chinese landraces. The cluster analysis classified the materials into two groups: a major and a minor group. The minor group comprised 14 landraces collected mainly in Guangdong and Fujian, and two cultivars (cv. Nancy Hall and cv. Xu78-1) that are distantly related to each other. The major group consisted of the other 92 accessions. These results indicate that the Chinese sweet potato landraces not only exhibit a high level of genetic diversity but also have a different genetic background from cultivars in China

  • français

    Pour analyser la diversité génétique et les relations entre variétés locales et cultivars de patate douce en Chine, une centaine de variétés locales de six régions géographiques chinoises ainsi que huit cultivars ont été évalués en utilisant des marqueurs d’amplification intermicrosatellites (ISSR). Quatorze amorces ISSR ont permis d’obtenir 239 bandes polymorphes avec une moyenne de 17 bandes polymorphes par amorce. Une distance génétique moyenne élevée et une large variation ont été observées parmi les variétés chinoises locales, qui sont également éloignées des cultivars présentant une distance génétique moyenne de 0,6428 (gamme de 0,2591 à 1,6428). Le dendrogramme obtenu par groupement de paires non pondérées avec moyenne arithmétique (UPGMA) révèle la même relation génétique entre les cultivars, ce qui concorde avec leur origine (connue) et la très grande diversité génétique des variétés locales chinoises. L’analyse de groupes (clusters) des matériels permet de distinguer deux groupes : un groupe principal et un groupe mineur. Ce dernier comprend 14 variétés locales collectées principalement dans les provinces de Guangdong et Fujian et deux cultivars (cv. Nancy Hall et cv. Xu78-1) qui sont éloignés l’un de l’autre. Le groupe principal est constitué des 92 autres accessions. Ces résultats indiquent que les variétés locales de patate douce chinoise présentent non seulement un niveau élevé de diversité génétique mais ont également une base génétique différente de celle des cultivars chinois