El Basamento Metamórfico del archipiélago de Los Chonos, en su sector central, esta compuesto por rocas que, de acuerdo a su estructura, pueden ser agrupadas en dos zonas: La zona oriental (ZEP) se caracteriza por presentar estructuras primarias conservadas; en ella se observa una alternancia irregular, en partes deformada al estilo "melange", de lutitas negras, pizarras, areniscas grises y radiolaritas. La segunda zona (ZSEP), ubicada al oeste de la anterior, presenta sus estructuras primarias obliteradas y una litología que corresponde a una serie monótona de filitas y "cuarcitas" con intercalaciones de metabasitas.
Las rocas del Basamento fueron afectadas por dos etapas principales de deformación. Durante la etapa temprana (D1), la estratificación (S0) fue plegada según pliegues isoclinales y chevrones apretados, asociados a un clivaje de plano axial (S1), de rumbo variable. La etapa tardía (D2) se caracteriza por una deformación no homogénea, progresiva, con intensidad creciente hacia el oeste, que se manifiesta por el desarrollo de un clivaje de crenulación (S2) de rumbo NNW y subvertical en la ZEP. Hacia el oeste, en la ZSEP, esta foliación es subhorizontal, obliterando completamente las fabricas tempranas.
Situaciones estructurales similares a las observadas en este sector central del archipielago de Los Chonos, han sido descritas en el "Basamento" del archipielago de Las Guaitecas, en la Cordillera de Nahuelbuta y en el interfluvio inferior de los ríos Mataquito y Maule.
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