La fiebre aftosa está causada por un picomavirus denominado virus de la fiebre aftosa (VFA). El virión contiene una molécula de RNA infeccioso de una sola banda, empaquetado en una cápsida icosahédrica formada por cuatro proteínas distintas. La aplicación de las técnicas de ingeniería genética ha permitido determinar secuencias de nucleótidos del genoma de varios VFA y asignar las zonas que coditican proteínas estructurales y las que coditican las no estructurales. El RNA se traduce en una poliproteína que se procesa para dar las proteínas maduras. La comparación de secuencias ha puesto de relieve una elevada variación genética; en particular para la proteína inmunogénica VPl. La . omparación de mapas de oligonucleótidos del RNA de mµchos aislados de VFA sugiere que cada virµs es único en secuencia. Las poblaciones del VFA no pueden describirse como una estructura única, sino como un conjunto da estructuras cuya fluctuación ocasiona la rápida evolución viral. Este modelo de organización génica se denomina de cuasiespecies o distribución de secuencias y describe adecuadamente el comportamiento del VFA y de otros virus de interés médico y veterinario. A la variabilidad genética parece corresponder una variedad de comportamientos biológicos. Entre las variaciones, la antigénica es la más notoria, ya que ha sido observada de modo directo por los métodos empleados en el diagnóstico de la enfermedad.
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