Análisis poblacional del ganado Holstein de Antioquia a partir de un polimorfismo del gen POU1F1

• Isaza, J.V. ^[1] ; López, A. ^[1] ; Echeverri, J.J. ^[1]
  1. [1] Universidad Nacional de Colombia

     Universidad Nacional de Colombia

     Colombia

     
• Localización: Archivos de zootecnia, ISSN-e 1885-4494, ISSN 0004-0592, Vol. 66, Nº. 254, 2017, págs. 215-221
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Population analysis of the Holstein cattle from Antioquia based on one polymorphism of the POU1F1 gene
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• Resumen
  • español

    El objetivo de esta investigación fue analizar la estructura y diferenciación genética de una población de vacas Holstein de Antioquia a partir de un polimorfismo del gen POU1F1. Para esto se genotipificó mediante la técnica PCR-RFLP 503 vacas Holstein de 15 hatos ubicados en 7 municipios del departamento de Antioquia. Los parámetros de estructura, diversidad genética y número de migrantes se determinaron utilizando el software GenAlex versión 6.5. El fragmento amplificado de 451 pb presento un sitio de corte para la enzima HinfI, generando un fragmento para el alelo A y dos fragmentos para el alelo B. Las frecuencias alélicas fueron 0,213 para el alelo A y 0,787 para el alelo B. Las frecuencias genotípicas fueron 0,029, 0,368 y 0,603 para AA, AB y BB, respectivamente. La heterocigosidad observada, 0,368, y la esperada, 0,334, presentaron diferencias significativas, indicando un exceso de heterocigotos, por lo cual la población no se encontró en equilibrio de Hardy-Weinberg. Los valores de FST, FIS y FIT fueron 0,002, -0,103 y -0,100 respectivamente, indicando una baja o nula diferenciación genética entre las subpoblaciones. El número de migrantes encontrado fue de 134,51 individuos por generación. Pese a que las subpoblaciones evaluadas están geográficamente dispersas, el flujo genético ha contrarrestado la deriva genética, permitiendo que estas sean una sola población.

  • English

    The objective of this research was to analyze the genetic structure and differentiation of an Antioquian population of Holstein cows based on one polymorphism of the POU1F1 gene. A total of 503 Holstein cows from 15 herds located at 7 municipalities of Antioquia were genotyped using the PCR-RFLP technique. Structure and genetic differentiation parameters and number of migrants were determined with GenAlex 6,5 software. The amplified fragment of 451 bp had one cleavage site for the HinfI enzyme, generating one fragment for the A allele and two fragments for the B allele. Allelic frequencies were 0.213 for A and 0.787 for B. The genotype frequencies were 0.029, 0.368 and 0.603 for AA, AB and BB, respectively. The observed (0.368) and expected (0.334) heterozygosity showed significant differences, indicating an excess of heterozygosity, and therefore departure from the Hardy-Weinberg equilibrium. The found values for FST, FIS y FIT were 0.002, -0.103 and -0.100 respectively, indicating little or no genetic differentiation among subpopulations. The estimated number of migrants was 134.51 individuals per generation. Although the subpopulations evaluated are geographically dispersed, genetic flow has counteracted genetic drift, allowing them to be a single population.