Detección del potato virus y (pvy) en tubérculos de papa mediante tas-elisa y qrt-pcr en Antioquia (Colombia)

• Medina Cárdenas, Héctor Camilo ^[1] ; Gutiérrez Sánchez, Pablo Andrés ^[1] ; Marín Montoya, Mauricio ^[1]
  1. [1] Universidad Nacional de Colombia

     Universidad Nacional de Colombia

     Colombia

     
• Localización: Bioagro, ISSN 1316-3361, ISSN-e 2521-9693, Vol. 27, Nº. 2, 2015, págs. 83-92
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Detection of Potato virus Y (PVY) in potato tubers in Antioquia (Colombia) using TAS-ELISA and qRT-PCR
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• Resumen
  • español

    El PVY es uno de los problemas virales más incidentes y limitantes para la producción de papa en Colombia y otros países. Es transmitido por áfidos y por tubérculo-semilla, lo que genera un proceso de acumulación de virus y disminución progresiva de rendimientos cuando no se utiliza semilla certificada. En este trabajo se determinó la presencia y distribución de PVY en tubérculos de Solanum tuberosum variedad Diacol-Capiro y S. phureja variedad Criolla-Colombia obtenidos en Antioquia (Colombia), utilizando TAS-ELISA y qRT-PCR. Se evaluaron 16 muestras de cada variedad y cuatro tipos de tejido (cáscara, yemas, ápice y base de brotes) y se compararon los niveles de detección alcanzados por ambas técnicas. Cuando se utilizó qRT-PCR se encontró PVY en 100 % de los tubérculos de Diacol-Capiro y en 66,6 % de Criolla-Colombia; mientras que mediante TAS-ELISA este valor fue de 75 % para Diacol-Capiro y no se detectó el virus en ninguna muestra de Criolla-Colombia. Al evaluar los ciclos umbral (Ct) obtenidos por qRT-PCR, fue evidente que dichas diferencias se debían principalmente al bajo título viral alcanzado en Criolla-Colombia (Ct promedio=32,4) con respecto a Diacol-Capiro (Ct promedio=15,54), lo que imposibilita la detección de PVY por pruebas menos sensibles como TAS-ELISA. Con respecto a la distribución de PVY, se encontró mayor acumulación viral en los ápices de los brotes de ambas variedades (Diacol-Capiro Ct =11,53 y Criolla Colombia Ct=27,52). Estos hallazgos enfatizan la necesidad de utilizar tubérculo-semilla certificado por su sanidad viral en los cultivos de papa y del fortalecimiento de dichos programas a partir del empleo de técnicas de detección viral altamente sensibles como qRT-PCR.

  • English

    PVY is one of the viruses with highest incidence and severity in potato crops in Colombia and other countries. This virus is transmitted by aphids and tuber seeds and can progressively reduce crop yields due to viral accumulation when non-certified seed is used. In this work, the incidence and distribution of PVY in tubers of Solanum tuberosum v. Diacol-Capiro and S. phureja v. Criolla-Colombia from Antioquia (Colombia) was evaluated using TAS-ELISA and qRT-PCR. For both varieties, 16 samples from four different tissues (skin, dormant buds, base and tip of sprouts) were used and detection levels were compared for both techniques. With qRT-PCR, PVY was detected in 100 % and 66.6 % of Diacol-Capiro and Criolla-Colombia tubers, respectively. In contrast, TAS-ELISA detected PVY in only 75 % of Diacol-Capiro samples and none of Criolla-Colombia. Low titer values may explain the failure to detect PVY by TAS-ELISA in some samples that tested positive by qRT-PCR in Criolla-Colombia (Ct=32.4) and Diacol-Capiro (Ct=15.54). Distribution analysis revealed that the highest accumulation of PVY was the tip region of sprouts in both varieties (Diacol-Capiro Ct=11.53 and Criolla-Colombia Ct=27.52). These findings demonstrate the need of using certified seed-tubers tested with highly sensitive methods like qRT-PCR.