El 2 de septiembre de 1762 el Virrey salió de Santafé hacia Cartagena, llevando consigo a Mutis. El 13 de enero de 1763 Mutis estaba en Mompós, en donde ejercía como Protomédica doña Juana de Mier, que era muy apreciada por sus buenos sentimientos, y quien informó a Mutis "de una enfermedad particular que padecían los niños, con tanta universalidad en todas estaciones, que se creía que de ella morían por lo menos más de la mitad.
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