Las recientes técnicas de secuenciación masiva de genomas completos y los análisis bioinformáticos nos permiten hoy en día detectar con precisión secuencias de origen microbiano en los genomas de muchos animales, incluido el humano. A lo largo de millones de años, estos “microorganismos” endógenos han contribuido a la evolución de los genomas de sus huéspedes introduciendo innovación y variabilidad genética e influyen actualmente en la expresión de sus genes. En concreto, los retrovirus endógenos tienen un papel esencial en la biología del huésped: han sido relacionados con varias enfermedades, han intervenido en la formación de la placenta y el desarrollo embrionario de los mamíferos, son responsables de proteger al huésped contra infecciones virales externas e incluso han tenido un papel esencial en la evolución de nuestra propia especie. Pero además de los retrovirus endógenos, los últimos datos demuestran que la transferencia horizontal de genes entre especies distintas ha contribuido también a la evolución de los animales.
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