Resumen de Un outil moléculaire pour détecter précocement le mildiou, l' oïdium et la pourriture grise dans les tissus de la vigne
Katia Gindro, Nicole Lecoultre, Jean-Pierre de Joffrey, Sylvain Schnee, Francine Voinesco, Olivier Viret, Pierre-Henri Dubuis
Une méthode simple et fiable a été mise au point pour détecter des propagules fongiques dans les tissus de la vigne par amplification directe par PCR, sans purifier préalablement l�ADN. Le potentiel de cette méthode est illustré par quelques exemples. Pour cela, différents échantillons de vigne ont été broyés en présence de polyvinylpolypyrrolidone et utilisés directement comme matrice pour l�amplification par PCR avec des amorces spécifiques pour la vigne et ses trois principaux pathogènes fongiques, Plasmopara viticola, Erysiphe necator et Botrytis cinerea. La spécificité des amplifications a été validée par séquençage des produits de PCR. Des séries de dilution des différentes propagules fongiques étudiées ont montré la grande sensibilité des réactions pour P. viticola, B. cinerea et E. necator, soit un sporange ou une seule conidie chaque fois. La microscopie permet de visualiser les spores et autres propagules fongiques dans les tissus végétaux, notamment les bourgeons dormants ou les fleurs de la vigne, sans toutefois pouvoir identifier les espèces présentes, ce qui a été réalisé en parallèle par PCR directe. L�oïdium et la pourriture grise ont été détectés respectivement dans 29 et 65 % des bourgeons analysés. Le mildiou a été recherché dans les feuilles juste après des épisodes de pluie ou de rosée potentiellement infectieux. La pourriture grise a été trouvée dans des fleurs asymptomatiques après visualisation par microscopie et identification par PCR directe. Des observations microscopiques de rafles asymptomatiques ont décelé la présence d�hyphes, que la PCR directe a attribuées à P. viticola. La validation et l�utilisation de cette méthode sont discutées comme complément à la microscopie, notamment pour l�étude de l�épidémiologie de champignons biotrophes.
