Resumen de Análisis de la diversidad genética de 21 aislamientos del hongo Moniliophthora roreri basado en marcadores RAPD

Boris Gutarra, María Silva, Kadir Márquez, Betsabé León

• español

  Objetivos: Estudiar la diversidad genética de 21 aislamientos del hongo que afecta al cultivo del cacao, Moniliophthora roreri, en tres zonas cacaoteras del Perú (Tocache, Mariscal Cáceres y Leoncio Prado). Métodos: Se utilizó 14 iniciadores RAPD (random amplified polymorphic DNA) polimórficos y una pareja de oligonucleótidos, los que fueron empleados bajo condiciones de amplificación estandarizadas. Con los datos obtenidos se construyó un dendograma utilizando el coeficiente de Jaccard y el algoritmo UPGMA (Unweighted Pair-Group Method using Arithmetic Average). La estructura genética fue estimada en función del análisis molecular de variancia (AMOVA) y la diversidad mediante los índices de Shannon y Nei. Resultados: Fueron conseguidas 59 bandas RAPD con un 73% de polimorfismo. El dendograma obtenido a un índice de similitud de 0,70, claramente dividió los individuos en tres grupos. El análisis de la diversidad genética mostró altos valores en las zonas estudiadas de acuerdo con el índice de Shannon (0,3936) y de Nei (0,2622), con mayor riqueza en Leoncio Prado. Estas zonas presentan alta variabilidad, y según el AMOVA realizado: 88% entre accesiones por zona y solo 12% entre zonas. Conclusiones: Existe más de un grupo genético de Moniliophthora roreri en la Amazonía del Perú. Estos grupos, provenientes del Ecuador, pudieron haber ingresado por el intercambio de semillas y/o de forma natural por medio de los ríos en común y estarían originando nuevos grupos genéticos locales.

• English

  Objectives: To study the genetic diversity of 21 fungus’ isolations that affect cocoa crops, Moniliophthora roreri in three cocoa areas (cacaoteras) from Peru (Tocache, Mariscal Cáceres and Leoncio Prado). Methods: 14 polymorphic RAPD indicators (random amplified polymorphic DNA) and an oligonucleotides pair were used, which were employed under standardized amplification terms. With the obtained data a dendrogram was constructed using the Jaccard coefficient and the UPGMA (Unweighted Pair-Group Method using Arithmetic Average) algorithm. The genetic structure was estimated based on the variance molecular analysis (AMOVA) and the diversity based on the Shannon and Nei indices. Results: We collected 59 RAPD bands with 73% of polymorphism. The obtained dendrogram at a similarity index of 0,70, it clearly divided the individuals in three groups. The genetic diversity analysis showed high values in the three studied areas according to the Shannon index (0,3936) and Nei (0,2622), more richly in Leoncio Prado. The three areas have high variability within them, according to the performed AMOVA: 88% between accessions by area and only 12% between areas. Conclusions: The existence of more than one genetic group of Moniliophthora roreri in the Peru’s Amazonia arises. These groups from Ecuador, may have entered by the exchange of seeds and/or in a natural way by rivers in common and they would be originating new local genetic groups.