Resumen de Comparación de dos métodos de extracción de ADN a partir de plantas del género Solanum, subgénero Leptostemonum

Isabel Cristina Cadavid Sánchez, Doris Amanda Rosero García, Sandra Inés Uribe Soto

• español

  Se evaluaron dos métodos para la extracción de ADN en plantas del género Solanum, con el fin de obtener ADN disponible y de buena calidad para la obtención de secuencias. El producto comercial DNeasy® Plant Mini Kit se comparó con un método que incluye el uso de una solución tampón de lisis. Para este último método también se evaluó si el rendimiento mejoraba cuando las muestras se maceraron previamente con nitrógeno líquido. Los resultados en términos de calidad (A260/A280) no mostraron diferencias significativas entre los métodos de extracción (índice < 1,5). Sin embargo, se encontraron diferencias en la concentración de ADN obtenida (prueba de Dunnet, p<0,05) y en los porcentajes de amplificación mediante PCR (X2, p<0,05). Los mejores resultados, en cuanto al éxito en la PCR (89%), se obtuvieron con el producto comercial, sin embargo la dilución 1:100 de las muestras obtenidas con el método de solución de lisis, permitió obtener resultados de PCR comparables. La maceración de las muestras con nitrógeno líquido, también mejoró el rendimiento (éxito de PCR) del método con solución de lisis. Se propone este método como una alternativa costo-efectiva para la extracción de ADN a partir de plantas del género evaluado, con base en los resultados obtenidos.

• English

  Two methods were evaluated for ADN extraction in plants belonging to the Solanum genus. The objective was to isolate adequate ADN amount and of enough quality for obtaining sequences. The commercial product DNeasy® Plant Mini Kit was compared with a method that includes a lysis buffer. For the last method it was also evaluated the improvement when samples were previously macerated with liquid nitrogen. The quality results (A260/A280) did not show significant differences between the extraction methods (index <1.5). However, there were differences in the ADN concentration obtained (Dunnett test, p <0.05) and in the PCR amplification percentages (X2, p <0.05). The best results, in terms of success in PCR (89%) were obtained with the commercial product, however the PCR with 1:100 dilution of extracted ADN using the buffer lysis method achieve comparable results. Grounding the samples with liquid nitrogen with this method, also upgraded the PCR results. Based on the results in this study the lysis buffer method is proposed as a cost-effective alternative for ADN extraction in plants belonging to the evaluated genus.