El mapa genético informa de la situación de los genes en relación con su independencia o ligamiento y representa la distancia física existente entre ellos. Se construye mediante análisis de ligamiento utilizando marcadores genéticos y más concretamente marcadores de DNA que sean polimórficos. Entre los principales marcadores se utilizan para este fin: RFLPs, VNTRs, satélites, midi, mini y microsatélites y RAPDSs. A partir de su análisis se estudia el ligamiento entre dos o más loci calculando la frecuencia de recombianción entre ellos y en definitiva la distancia física la distancia entre los loci ligados.
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