Molecular recognition of a cyclophane as a receptor towards arginine methyl ester: theoretical perspectives

• Autores: Abigail Miranda de la Rosa, Aned de Leon, Enrique F. Velázquez, Rocío Sugich Miranda, Rogerio R. Sotelo Mundo, Motomichi Inoue
• Localización: Afinidad: Revista de química teórica y aplicada, ISSN 0001-9704, Vol. 70, Nº. 561, 2013, págs. 64-69
• Idioma: inglés
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• Resumen

  • En este estudio nos enfocamos en el reconocimiento molecular de arginina con un ciclofano como receptor. Este macrociclo consiste de dos unidades fenileno-0-fenileno unidas por dos cadenas EDTA y contiene cuatro grupos carboxilato pendientes. Para entender las interacciones de estos sistemas realizamos una búsqueda conformacional y optimizaciones geométricas con el uso de la Teoría del Funcional de la Densidad (DFT). Decidimos enfocarnos en dos diferentes escenarios. En el primero, la arginina metiléster y el ciclofano no están cargados. En el segundo, ambas especies son iónicas y el sistema globalmente es neutral. Los cálculos revelan que de hecho interactúan favorablemente, donde la configuración más estable es aquélla en la cual la arginina metiléster catiónica se extiende sobre el ciclo e interactúa con los grupos carboxilato desprotonados.