Comparación de modelos novedosos de proximidad en quimioinformática

• Autores: Oscar Miguel Rivera Borroto, Yoandy Hernández Díaz, José Manuel García de la Vega, Ricardo del Corazón Grau Ábalo, Yiovani Marrero Ponce
• Localización: Afinidad: Revista de química teórica y aplicada, ISSN 0001-9704, Vol. 69, Nº. 560, 2012, págs. 272-277
• Idioma: español
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• Resumen

  • El presente trabajo comprende la implementación computacional en el ambiente Java de 21 modelos de proximidad para usarlos en experimentos simulados de búsqueda de similitud; nueve de estos modelos son novedosos en Quimioinformática pues proceden del área de la Psicología, los otros 12 son medidas ya establecidas de la literatura especializada. Posteriormente, las medidas de similitud fueron comparadas y validadas en la "recuperación temprana" usando nueve conjuntos de datos de la Química Medicinal, representados por descriptores numéricos seleccionados por Aprendizaje Automático y un algoritmo de búsqueda eficiente. Los resultados muestran que en tendencia promedio los nuevos modelos se comportan superiormente a los de referencia y que más de la mitad de los mismos se sitúan entre los diez modelos más potentes.