Las toxinas juegan un papel esencial en Homotoxicología. Aunque la moderna Medicina Antihomotóxica ha evolucionado, por ejemplo, en el tratamiento de las consecuencias de la disregulación, la detoxificación sigue siendo uno de los principales pilares del tratamiento. A pesar de que el hígado, riñones, mucosas (sistemas respiratorio, gastrointestinal y genitourinario) y piel son los principales órganos de detoxificación, es importante señalar que los componentes del sistema de autorregulación no se pueden separar, pues todos ellos actúan conjuntamente.
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