A core set of microsatelate markers identified for use in population genetic studies of Purple Swamphen (Porphyrio porphyrio)

• Autores: S. A. Subrata, Ilse Storch
• Localización: Animal Biodiversity and Conservation, ISSN 2014-928X, Vol. 35, Nº. 1, 2012, págs. 23-26
• Idioma: inglés
• Títulos paralelos:
  • Conjunto básico de marcadores de microsatélites identificados para el uso en estudios de genética de poblaciones en calamón común (Porphyrio porphyrio) en Java.
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• Resumen
  • español

    Las poblaciones de calamón común han descendido en algunas partes del mundo debido a la degradación de los humedales y la caza furtiva. Los esfuerzos de conservación podrían beneficiarse de los estudios de genética de poblaciones que emplean marcadores de microsatélites. Aquí se describe la selección de los marcadores adecuados para tal estudio. Se han probado estos marcadores frente a la presencia de alelas nulos y desequilibrio gamético. De catorce loci candidatos, diez muestran una frecuencia de alelo nulo menor de 0,2 y no poseen desequilibrio de ligamiento significativo. Los loci seleccionados no presentaron desviación del equilibrio de Hardy-Weinberg (HWE) y tienen un contenido de información polimórfica (PIC) medio de 0,516. Sobre la base de esta prueba, se sugiere que estos loci deben ser incluidos en estudios de genética de poblaciones de esta especie.

  • English

    Populations of Purple Swamphen have been declining in some parts of the world due to wetland degradation and poaching. Conservation efforts might benefit from population genetic studies using microsatellite markers. Here we describe the selection of microsatellite markers suitable for such studies. We tested the markers against the evidence of the null alleles and gametic disequilibrium. From fourteen candidate loci, ten displayed a null alleles frequency of less than 0.2 and had no significant linkage disequilibrium. The selected loci showed no deviation from HWE and had a mean polymorphic information content of 0.516. Based on the test, we suggest these loci are suitable for population genetic studies of the species.