Caracterización molecular de las comunidades bacterianas asociadas a sedimentos de un sistema costero del norte de la corriente de Humboldt, bahía de Mejillones del Sur, Chile

• Autores: Rubén Araya, Juan C. Leiva, Jorge Valdés
• Localización: Revista de biología marina y oceanografía, ISSN 0718-1957, ISSN-e 0717-3326, Vol. 43, Nº. 3, 2008, págs. 547-557
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Molecular characterization of bacterial communities associated to sediments in the northern Humboldt Current system, Mejillones del Sur bay, Chile
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• Resumen
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    Para conocer la estructura de comunidades bacterianas asociadas a sedimentos marinos del sistema costero de la corriente de Humboldt en la bahía de Mejillones del Sur (23ºS), Chile, se realizaron análisis de electroforesis en gel de gradiente desnaturalizante (DGGE) a partir de fragmentos del 16S rADN para el Dominio Bacteria, junto con el análisis de escala multidimensional (MDS). Para esto, se realizaron muestreos de sedimentos en cuatro sectores dentro de la bahía de Mejillones del Sur, durante tres períodos de muestreo y cuatro profundidades. El análisis genético de las comunidades procarióticas estudiadas reveló una alta diversidad bacteriana, la cual se estableció por el gran número de bandas detectadas por DGGE. El análisis de MDS evidenció cambios en la estructura de las comunidades asociadas a los sedimentos recolectados a 10 m, entre las 4 estaciones de muestreo. Se encontraron además, diferencias en la estructura de comunidades procarióticas asociadas a las distintas profundidades analizadas. Esta variación en la estructura genética de las comunidades procarióticas estuvo influenciada por cambios en los patrones de circulación al interior de la bahía, los cuales se asociarían al efecto de los focos de surgencia que ingresan por el margen noreste de la bahía. En conclusión, la técnica de DGGE nos permitió establecer cambios en la estructura de las comunidades bacterianas a través del análisis cualitativo de muestras obtenidas en los diferentes sectores y tiempos de muestreo.

  • English

    To assess the structure of bacterial communities associated to coastal marine sediments of the Humboldt Current System of Mejillones bay (23ºS), Chile, we examined 16S rDNA fragments of Bacteria Domain by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE), along with multidimensional scaling analysis (MDS). Sediments were taken from four sampling stations located at the bay and samples from four different depth points were analyzed for three periods during one year. The genetic analysis of prokaryont communities revealed a high bacterial diversity product indicated by the high number of bands detected by DGGE. The MDS analysis showed changes among the bacterial communities in all sampling stations, particularly on the community structures of prokaryotic cells associated to sediments at 10 m, although we also found subtle differences in the structure of prokaryotic communities in all the depth analyzed. The findings of changes in the structure communities of prokaryotic cells could be triggered by changes in circulation water patterns inside the bay, which could be related to upwelling waters found at the northeast margin of the bay. In conclusion, the use of DGGE technique allowed us to establish bacterial community changes by qualitative analysis of samples obtained from different sampling stations at different periods.