Mitochondrial DNA D-loop analysis of South Western Nigerian chicken

• Autores: A.O. Adebambo
• Localización: Archivos de zootecnia, ISSN-e 1885-4494, ISSN 0004-0592, Vol. 58, Nº 224, 2009, págs. 637-643
• Idioma: inglés
• Títulos paralelos:
  • Analisis de D-loop ADN mitocondrial de pollos de SW Nigeria
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    Un segmento D-loop de AND mitocondrial (mtADN) fue secuenciado para un total de 98 pollos domésticos de SW Nigeria. Las poblaciones domésticas de pollos fueron: Anak titan (raza israelí, n= 1), Frizzle (n= 16), Opipi (n= 5), FrizzlexOpipi (n= 5), Fulani (n= 4), Giriraja (raza india, n= 3), Normal (n= 55), Cuello Desnudo (n= 8), Yaffa (n= 1). Las secuencias de los primeros 397 nucleotidos fueron usadas para el análisis. Diecisiete haplotipos de 23 sitios polimórficos, fueron identificados en las muestras: 15 para las poblaciones indígenas nigerianas de pollos, 1 para Giriraja y 1 para Anak Titan. El análisis filogenético, muestra que los pollos indígenas nigerianos pueden agruparse todos dentro del clade IV, mientras que el Giriraja indio, se encuadró en el clade IIIc. El clade IV tiene 16 haplotipos mientras que el clade IIIc tiene sólo un haplotipo. El análisis AMOVA indica que el 97,32% de la variación total de la secuencia entre haplotipos estuvo presente dentro de la población y el 2,68% entre poblaciones. Los resultados sugieren un solo origen maternal múltiple para los pollos domésticos de SW Nigeria.

  • English

    Mitochondrial DNA (mtDNA) D-loop segment was sequenced for a total of 98 individuals of domestic chicken from South Western Nigeria. Domestic chicken populations were: Anak titan (Israeli breed,n= 1), Frizzle (n= 16), Opipi (n= 5), FrizzleXOpipi (n= 5), Fulani (n= 4), Giriraja (Indian breed,n= 3), Normal (n= 55), Naked neck (n= 8), Yaffa (n= 1). The sequences of the first 397 nucleotides were used for the analysis. Seventeen haplotypes were identified in the samples, 15 for Nigerian indigenous chicken population, 1 for Giriraja and 1 for Anak titan from 23 polymorphic sites. Phylogenetic analysis shows that Nigerian indigenous and Anak titan chicken were all grouped under clade IV, while the Indian Giriraja was under clade IIIc. Clade IV had 16 haplotypes, while clade IIIc had one haplotype. AMOVA analysis indicates that 97.32% of the total sequence variation between haplotypes was present within population and 2.68% between populations. Our results suggest single multiple maternal origins for the South Western Nigerian domestic chicken.