La alteración y desarticulación de gran parte del avenamiento, así como de la vegetación fratofita asociada, obedece a diversas causas, algunas de ellas ligadas a la intensa transformación del territorio por los monocultivos forestales de Pinus pinea y Eucaliptus spp. A pesar de todo, la génesis de estas alteraciones es anterior, y dado el análisis cartográfico detallado sólo puede obedecer a alteraciones con una mayor escala temporal, por lo que sólo parece explicable por modificaciones climáticas similares a las que ya han sido descritas para el vecino Parque Nacional de Doñana
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