Short communication: Cloning and sequencing of partial genomic DNA fragments corresponding to the S11 and S12 alleles of the Spanish almond cultivar ¿Marcona¿

• Autores: Antonio Sánchez-Sánchez, Ossama Kodad, N. Saibo, José Manuel Alonso Segura, M. Margarida Oliveira, Rafel Socias i Company
• Localización: Spanish journal of agricultural research, ISSN-e 2171-9292, ISSN 1695-971X, Nº. 4, 2006, págs. 331-335
• Idioma: inglés
• Títulos paralelos:
  • Nota corta: clonación y secuenciación de fragmentos de ADN genómico correspoendientes a los alelos S 11 y S 12 del cultivar español de almendro "Marcona"
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• Resumen
  • español

    Este trabajo muestra la clonación y el análisis de secuencias de fragmentos de DNA genómico correspondientes a dos S-RNasas (S11 y S12) de almendro. Estos fragmentos se amplificaron mediante PCR a partir de DNA del cultivar 'Marcona', el más apreciado en el mercado español, utilizando la pareja de cebadores AS1II y AmyC5R, diseñados en regiones conservadas de los alelos S de almendro. El alelo S11 fue clonado y secuenciado en 'Marcona', y es idéntico al clonado y secuenciado previamente en 'Rumbeta' y 'Bertina'. En cambio, es la primera vez que el alelo S12 se secuencia en almendro. El fragmento analizado de este alelo contiene el segundo intrón (1080 pb) y secuencias parciales del segundo y tercer exón (506 pb). La amplificación específica por PCR mostró que el cultivar español 'Marcona' y el portugués 'Pestaneta' poseen el mismo alelo S12. La secuenciación de estos alelos permitirá, no sólo diseñar cebadores específicos para S11 y S12, sino también aplicar posiblemente la tecnología anti-sentido en ingeniería genética.

  • English

    This paper reports the cloning and partial genomic DNA sequencing of two S-RNases (S11 and S12) of almond. DNA from the Spanish almond cultivar Marcona, the most highly appreciated in Spain, was amplified by PCR using the primer pair AS1II and AmyC5R designed for the conserved regions of almond S-alleles. The cloned and sequenced S11 allele of cv. Marcona appears to be identical to that of cvs. Rumbeta and Bertina (which have been previously cloned and sequenced). This is the first time, however, that S12 has been sequenced in almond. The amplified and cloned S12 allele fragment possessed 1080 bp corresponding to the second intron and 506 bp corresponding to the second and third exons. The product of PCR-specific amplification showed that cv. Marcona and the Portuguese cultivar Pestaneta carry the same S12 allele. Knowledge of the sequences of these alleles will be helpful in the design of specific primers for S11 and S12, and could be of use when employing antisense techniques in genetic engineering projects.