El control de los miroorganismos orales posee una gran importancia para la recuperación y la conservanción de la salud bucal, debido a que éstos desempeñan un papel clave en la aparición de la caries dental y las periodontopatías. Además de la eliminación puramente mecánica de los depósitos bacterianos sobre los dientes a través del cepillado o de la higiene bucal realizada por profesionales, también es posible inhibir significativamente la proliferación de gérmenes orales mediante tratamientos químicos adecuados. El amplio espectro de acción de la clorhexidina (CHX) de carácter inespecífico, su baja toxicidad sistématica y la duración prolongada de su efecto la convierten, en sus diferentes formas de presentación, en al antiséptico oral por excelencia. La CHX se puede utilizar para una infinidad de aplicaciones diferentes como, por ejemplo, la reducción inespecífica del desarrollo de la placa sobre las superficies dentales (cepillo de dientes químico), la interacción selectiva sobre la microflora de las bolsas de pacientes con enfermedad periodontal, la eliminación de la microflora cariogénica en pacientes con alta actividad de caries, el tratamiento de la candidiasis y la desinfección del sistema de conductos radiculares en los tratamientos endodóndicos.
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