Prevalence of Burkholderia glumae in rice crops in Ecuador

• Autores: Lenin Paz Carrasco, Luz Diana Intriago Mendoza, Marcos Fernando Basso, Roberto Celi Herán
• Localización: The Journal of Agriculture, ISSN-e 2308-1759, Vol. 102, Nº. 1-2, 2018 (Ejemplar dedicado a: Vol. 102, No. 1-2, 2018), págs. 65-78
• Idioma: inglés
• Títulos paralelos:
  • Prevalencia de Burkholderia glumae en cultivos de arroz en Ecuador
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  • español

    Burkholderia glumae es el agente causal de la enfermedad del añublo bacterial de la panícula (bacterial panicle blight disease, BPBD) que causa daños severos al cultivo de arroz mundialmente. Del 2012 al 2013, los síntomas del BPBD se observaron en el cantón de Palestina, de la provincia del Guayas, Ecuador. En el 2014, se confirmó la presencia de B. glumae en este cantón. En vista de la importancia socio económica del cultivo del arroz en Ecuador, el objetivo de esta investigación fue investigar la prevalencia de B. glumae en otras localidades productoras de arroz. Se caracterizaron dieciocho aislados de bacterias obtenidas de granos afectados. Ensayos fisiológicos, bioquímicos, serológicos y moleculares que incluyeron la amplificación de la región ITS 16S-23S del ARNr de los aislados confirmaron la identidad de B. glumae. Ensayos de patogenicidad realizados en panículas de la variedad de arroz INIAP 15 verificaron la habilidad de cuatro aislados (i.e., EC-EELS-01, -02, -03 y -07) para causar descoloración, manchado y granos vanos que corresponden a síntomas asociados a BPBD. Los ensayos con antibióticos mostraron que el aislado EC-EELS-01 era sensible a la ciprofloxacina y a la tetraciclina y resistente a la polimixina. La diseminación y prevalencia de B. glumae se corroboraron en las áreas productoras de arroz en las provincias de El Oro, Cañar, Guayas y Los Ríos. Esta investigación proveerá una base para desarrollar un estudio genético y caracterizar la estructura poblacional de B. glumae en Ecuador.

  • English

    Burkholderia glumae is the agent responsible for bacterial panicle blight disease (BPBD) of rice that causes severe damage to this crop worldwide. During 2012 and 2013, symptoms of BPBD were observed in Palestina city, located in Guayas province, Ecuador. In 2014, the presence of B. glumae was confirmed at this location. In view of the socio-economic importance of rice in Ecuador, this research aimed to investigate the prevalence of B. glumae in other rice-producing regions. Eighteen bacterial isolates obtained from blighted kernels were characterized. Physiological, biochemical, serological, and molecular assays and the amplification of the 16S-23S rRNA ITS of the bacterial isolates collected confirmed the identity of the BPBD-associated bacterium. Pathogenicity assays verified the ability of these isolates to produce discoloration, spotting, and empty grains, symptoms associated with BPBD. Antibiotic assays showed that EC-EELS-01 isolate was sensitive to ciprofloxacin and tetracycline, and resistant to polymyxin. The dissemination and prevalence of B. glumae were confirmed in the rice-producing areas of El Oro, Cañar, Guayas, and Los Rios provinces. This research will serve to develop genetic studies to characterize the population in the B. glumae isolates in Ecuador.