Molecular and Biological Properties of a Putative Partitivirus from Jalapeño Pepper (Capsicum annuum L.)

• Rodrigo A. Valverde ^[1] ; Dina L. Gutierrez ^[1]
  1. [1] Louisiana State University

     Louisiana State University

     Estados Unidos

     
• Localización: Revista mexicana de fitopatología, ISSN-e 2007-8080, ISSN 0185-3309, Vol. 26, Nº. 1, 2008
• Idioma: inglés
• Títulos paralelos:
  • Propiedades biológicas y moleculares de un posible partitivirus de chile jalapeño (Capsicum annuum L.)
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• Resumen
  • español

    Cincuenta plantas de chile Jalapeño M (JM) (Capsicum annuum) mantenidas en invernadero fueron evaluadas para la presencia del virus críptico: Pepper criptic virus-1 (PCV-1) a través del análisis del RNA viral de doble cadena, el cual dio como resultado dos líneas de JM. Una de ellas se designó JM-N debido a la ausencia del PCV-1 en esta línea. Mientras que la otra línea se designó JM-P, positiva a la presencia del PCV-1. Ambas líneas fueron susceptibles a la infección natural por el virus Cucumber mosaic virus y su RNA satelital. PCV-1 no se pudo transmitir por injerto, pero si por semilla, paternal (polen) y maternalmente (óvulo). La secuencia parcial del gen que codifica para la RNA polimerasa RNA-dependiente se obtuvo de tres clones superpuestos del cDNA proveniente del RNA viral de doble cadena del PCV-1. La similitud de la secuencia de aminoácidos se analizó a través del programa NCBI BLAST dando como resultado alineamientos significativos con la RNA polimerasa RNA-dependiente del virus Beet cryptic virus-3 y varios posibles miembros de la familia Partitiviridae. Los resultados de la presente investigación indican que PCV-1 es una especia distinta de la familia Partitiviridae.

  • English

    Screening 50 greenhouse grown Jalapeño M (JM) (Capsicum annuum) pepper plants for the presence of pepper cryptic virus - 1 (PCV-1) by dsRNA extraction and analysis by electrophoresis, resulted in two JM lines. One was PCV-1 free and designated JM-N. The other one was PCV-1 positive and designated JM-P. Both lines were susceptible to natural infection by Cucumber mosaic virus and its satellite RNA. PCV-1 was not graft transmitted but it was transmitted both paternally (pollen) and maternally (ovule). Partial sequence of the RNA-dependent RNA polymerase gene was obtained from three overlapping cDNA clones derived from PCV-1 dsRNA. A search for aminoacid sequence similarity using the NCBI BLAST resulted in significant alignments with the RNA dependent RNA polymerase of Beet cryptic virus -3 and several putative members of the family Partitiviridae. Data presented indicate that PCV-1 is a distinct species of the family Partitiviridae.