Detección de influenza aviar en la Reserva de la Biosfera Cabo de Hornos: muestreo preliminar en el canal Beagle, Chile, 2024-2025

• Sánchez-Rodríguez, Fernanda ^[1] ; Guzmán, Natalia ^[1] ; Rivero de Aguilar, Juan ^[2] ; Valeris-Chacín, Carlos E. ^[2] ; Rozzi, Ricardo ^[2] ; Jimenez-Bluhm, Pedro ^[1]
  1. [1] Pontificia Universidad Católica de Chile

     Pontificia Universidad Católica de Chile

     Santiago, Chile

     
  2. [2] Universidad de Magallanes

     Universidad de Magallanes

     Punta Arenas, Chile

     
• Localización: Los Anales del Instituto de la Patagonia, ISSN-e 0718-686X, Vol. 54, Nº. 1, 2026
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Detection of avian influenza in the Cape Horn Biosphere Reserve: preliminary sampling at the Beagle Channel, Chile, 2024-2025
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  • español

    Los virus de influenza aviar (VIA) son patógenos importantes en aves acuáticas silvestres a nivel mundial; sin embargo, su presencia en regiones subantárticas sigue siendo en gran medida desconocida. Para abordar esta brecha en el conocimiento, se presentan aquí datos de vigilancia obtenidos en la Reserva de la Biosfera Cabo de Hornos, en el extremo sur de Chile, durante las temporadas reproductivas australes de 2024-2025. En total, se recolectaron 352 muestras fecales de sitios costeros, islotes y aves paserinas en programas de monitoreo a largo plazo. Solo una muestra ambiental obtenida en Punta Gusano en enero de 2024 resultó positiva mediante RT-PCR en tiempo real (Ct 36,78), lo que corresponde a una tasa de detección del 0,625%, mientras que todas las muestras de paserinos y de la temporada 2025 fueron negativas. Este único resultado débilmente positivo sugiere introducciones virales ocasionales, pero no hay evidencia de circulación sostenida. El hallazgo coincide con informes previos que muestran una dinámica activa de VIA en el norte y centro de Chile, pero una actividad muy limitada en la Patagonia. Asimismo, concuerda con los pocos casos confirmados de influenza aviar altamente patogénica H5N1 del clado 2.3.4.4b registrados en el extremo sur de Chile durante el brote de 2023. En conjunto, estas observaciones sugieren que el extremo sur de Chile sigue estando mínimamente afectado por los VIA. No obstante, su proximidad a la Antártida y su ubicación en la intersección de importantes rutas migratorias resaltan la importancia de mantener la vigilancia en estos ecosistemas remotos.

  • English

    Avian influenza viruses (AIVs) are important pathogens in wild aquatic birds worldwide, however, their presence in sub-Antarctic regions remains largely unknown. To address this gap, we report surveillance data from the Cape Horn Biosphere Reserve, in southernmost Chile, for the austral reproductive seasons of 2024–2025. In total, 352 fecal samples were collected from coastal sites, islets, and passerines in long-term monitoring programs. Only one environmental sample obtained at Punta Gusano in January 2024 tested positive by real-time RT-PCR (Ct 36.78), giving a detection rate of 0.625%, while all passerine and 2025 season samples were negative. This single weak positive result suggests occasional virus introduction, but there is no evidence of sustained circulation. The result agrees with previous reports showing active AIV dynamics in northern and central Chile, but very limited activity in Patagonia. The finding also matches the few confirmed highly pathogenic avian influenza H5N1 clade 2.3.4.4b cases recorded in southernmost Chile during the 2023 outbreak. Together, these observations suggest that southernmost Chile remains minimally affected by AIV. However, its proximity to Antarctica and location at a major migratory flyway intersection highlight the importance of continued surveillance in these remote ecosystems.