Resumen de Desarrollo de herramientas “user-friendly” para el análisis de datos de secuenciación masiva de ADN y la investigación de resistencias a antimicrobianos
Narciso Quijada, David Mendoza Salido, Alejandro Alcañiz, Bradd Hart, Carlos Sabater Sánchez, David Abad Hernández, Francesco Asnicar, Jorge Rodríguez Grande, José F. Cobo-Díaz, Livio Antonielli, María Dolores de Toro Jordano, Johanna Rhodes, Alicia Pageau, Anna Fijarczyk, Camille Bédard, Chris Lundry
En este trabajo presentamos varios software de código de código libre diseñados para el análisis de datos de secuenciación masiva de microbiomas con el objetivo de investigar las resistencias a antimicrobianos (RAM) con una premisa principal: que sean fáciles de usar. TORMES 2.0, transTORMES y torMAGs pueden trabajar directamente desde los archivos crudos de secuenciación y permiten el análisis completo de genomas bacterianos, la recuperación de MAGs de metagenomas y el análisis RNAseq. Respectivamente. ChroQueTas permite el análisis RAM en genomas fúngicos, buscando mutaciones en genes diana de los antifúngicos
