Microbial Diversity and Functional Profiles of Three Commercial Biofertilizers and Impacts on the Bacterial Communities of Avocado’s Soil Rhizosphere

• Renganathan, Prabhaharan ^[1] ; Andrade-Bustamante , Gabriela ^[2] ; Martínez-Ruíz , Francisco E. ^[2] ; Rueda Puente, Edgar Omar ^[1]
  1. [1] Universidad de Sonora

     Universidad de Sonora

     México

     
  2. [2] Universidad Estatal de Sonora

     Universidad Estatal de Sonora

     México

     
• Localización: Ciencia y Tecnología Agropecuaria, ISSN-e 0122-8706, Vol. 25, Nº. 1, 2024 (Ejemplar dedicado a: Ciencia & Tecnología Agropecuaria-Publicación continua (ene-abr))
• Idioma: inglés
• Títulos paralelos:
  • Diversidad microbiana y perfiles funcionales de tres biofertilizantes comerciales e impactos sobre comunidades bacterianas de la rizósfera del suelo en el aguacate
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• Resumen
  • español

    Las exportaciones de aguacate chileno (Persea americana Mill.) representan el 60 % de la producción total y son reconocidas por su alta calidad a nivel mundial. Sin embargo, su producción ha disminuido en los últimos años, como consecuencia de factores abióticos y bióticos. La aplicación de biofertilizante comercial a base de Microorganismos Promotores del Crecimiento Vegetal (PGPM, por sus siglas en inglés) es una práctica para aumentar la producción de aguacate y la resistencia a factores edafoclimáticos. El objetivo de éste estudio, fue determinar la funcionalidad de las comunidades microbianas presentes en tres biofertilizantes comerciales y así ofrecer una estructura de las comunidades microbianas asociadas, se analizó el suelo rizosférico del cultivo de aguacate mediante la técnica Biolog EcoPlate™, lo que suministró información sobre los perfiles fisiológicos a nivel de comunidades (CLPP, por sus siglas en inglés) y los índices de biodiversidad por electroforesis en gel con gradiente desnaturalizante (DGGE, por sus siglas en inglés). Los resultados muestran que la diversidad microbiana presente en los tres biofertilizantes comerciales fue variable con una disimilitud general SIMPER del 83,9 % en la capacidad catabólica. En relación con el impacto en las comunidades bacterianas del suelo de la rizósfera de los aguacates, hubo cambios significativos en la composición de las comunidades de rizobacterias, en particular con los Biofert A y C. Por el contrario, el Biofert B no mostró cambios significativos, especialmente en el día 15 y el día 30. Los estudios a largo plazo son recomendables para desarrollar prácticas agrícolas sostenibles para los aguacates chilenos.

  • English

    Chilean avocado (Persea americana Mill.) exports have accounted for 60 % of the total production and are recognized for their high quality worldwide. However, avocado production has significantly decreased in recent years, which is mainly attributed to abiotic and biotic factors, among which are high and low temperatures, intense and sudden rains, unavailability of water resources, and agricultural salinity. Secondary factors include pests and diseases. Applying plant growth promoting microorganisms (PGPM)-based commercial biofertilizers is a potential practice to increase avocado production and resistance to edaphoclimatic factors. In this study, to determine the functionality of microbial communities present in three commercial biofertilizers (Biofert A, Biofert B, and Biofert C) and thus offer a structure of associated microbial communities, the rhizospheric soil of avocado was analysed using the Biolog EcoPlate™ technique, providing information on the community level physiologic profiles (CLPP) and biodiversity indices by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). The findings revealed that the microbial diversity in the three commercial biofertilizers is highly different, showing a SIMPER overall dissimilarity of 83.9 % in the catabolic capacity. Concerning the impact on avocados’ rhizosphere soil bacterial communities, the results demonstrated significant changes in their composition, particularly with Biofert A and C. In contrast, Biofert B did not show significant changes, especially on days 15 and 30. Long-term studies are recommended to develop sustainable agricultural practices for Chilean avocados.