Diagnóstico de los errores innatos del metabolismo mediante secuenciación masiva de ADN: beneficios y limitaciones

• Vianey Ordóñez-Labastida ^[1] ; Juan C. Zenteno ^[2]
  1. [1] Departmento de Genética, Instituto de Oftalmología Conde de Valenciana, Ciudad de México; Unidad de Diagnóstico de Enfermedades Raras, Facultad de Medicina, Universidad Nacional Autónoma de México, Ciudad de México; Facultad de Medicina, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Cuernavaca, Morelos
  2. [2] Departmento de Genética, Instituto de Oftalmología Conde de Valenciana, Ciudad de México; Unidad de Diagnóstico de Enfermedades Raras, Facultad de Medicina, Universidad Nacional Autónoma de México, Ciudad de México. Facultad de Medicina, Departamento de Bioquímica, Universidad Nacional Autónoma de México, Ciudad de México. México
• Localización: Gaceta médica de México, ISSN 0016-3813, Vol. 161, Nº. 1, 2025, págs. 29-34
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Diagnosis of inborn errors of metabolism through massive DNA sequencing: benefits and limitations
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• Resumen
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    Los errores innatos del metabolismo (EIM) son enfermedades hereditarias causadas por alteraciones en genes involucrados en vías metabólicas de ácidos grasos, carbohidratos y proteínas. Aun cuando los programas de tamizaje neonatal han sido aplicados exitosamente desde hace varias décadas para identificar de manera oportuna a recién nacidos con EIM tratables y así disminuir la morbilidad y mortalidad asociada, la mayoría de los EIM no pueden ser identificados mediante cribado bioquímico.

    En años recientes, las tecnologías de secuenciación de ADN de nueva generación (NGS, también conocida como secuenciación masiva en paralelo) han revolucionado el diagnóstico de las enfermedades monogénicas, incluidos los EIM, mediante la aplicación de secuenciación de paneles de genes, secuenciación de exoma y secuenciación de genoma. En esta revisión narrativa, se presenta bibliografía seleccionada para mostrar un panorama general del estado actual del diagnóstico genético de los EIM con base en NGS, así como las limitaciones inherentes de esta tecnología. La NGS ha demostrado la capacidad de identificar a recién nacidos con enfermedades metabólicas que no podrían ser reconocidas sino hasta después del inicio de los síntomas.

    De manera importante, un subgrupo de estos pacientes recibe el beneficio de tratamientos individualizados oportunos.

  • English

    Inborn errors of metabolism (IEM) are inherited disorders resulting from genetic defects in proteins involved in breakdown or storage of fatty acids, carbohydrates and proteins. Collectively, IEM encompasses approximately 1000 different disorders and can affect up to 1 in 2000 births. While biochemical newborn screening programs have been successfully applied to early identify newborns with treatable IEM conditions and to reduce their associated morbidity and mortality, the great majority of known IEM are not recognizable through biochemical screening. In recent years, next generation DNA sequencing technologies (including sequencing of gene panels, exome sequencing, and genome sequencing) has revolutionized the genetic diagnosis of monogenic diseases, including IEM. Here, we present a narrative review with selected bibliography to show a general landscape about the status of NGS-based IEM diagnosis as well as its intrinsic limitations. NGS can detect newborns with metabolic diseases that may otherwise be clinically unrecognized until symptoms start. Importantly, a subgroup of these newborns will benefit from individualized medical management.