Migración de bromuro de etidio a GelRed en la tinción de ácidos nucleicos en gel de agarosa

• Autores: Oscar Arbizú Medina, Francisco Romero Oviedo, Yosimar Narváez Gonzalez, Roshell Rizo Obregón
• Localización: Revista Torreón Universitario, ISSN-e 2313-7215, ISSN 2410-5708, Vol. 13, Nº. 38, 2024, págs. 145-150
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • GelRed dye for staining nucleic acids in agarose gel was used in the molecular biology laboratory
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• Resumen
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    El bromuro de etidio (EtBr) es un colorante fluorescente ampliamente utilizado para la tinción de ácidos nucleicos en geles de agarosa y poliacrilamida. No obstante, el EtBr presenta varios incovenientes, como su alta toxicidad y capacidad mutagénica, lo que restringe su uso y manejo. En este estudio, se evaluó el uso de GelRed®, un colorante alternativo desarrollado por Biotium, que ofrece una mayor sensibilidad, seguridad y estabilidad que el EtBr. Se comparó el rendimiento de ambos colorantes para la tinción de ADN amplificado por PCR, utilizando los protocolos de BCR-ABL, JACK2, BLEE, Carbapenemasas IMP, VIM, SPM, GIM, NDM, KPC, OXA, mcr-1/mcr-2 y mecA. Los resultados indicaron que el GelRed® puede ser utilizado para visualizar el ADN con una intensidad de fluorescencia igual o mayor que la del EtBr, sin necesidad de modificar los protocolos de extracción, amplificación y electroforesis. Además, GelRed® no interfirió con las enzimas de restricción y la PCR, y no presenta efectos mutagénicos o citotóxicos. Se llega a la conclusión de que el GelRed® es una opción segura y sensible en comparación con el EtBr para la tinción de ácidos nucleicos en geles de agarosa.

  • English

    Ethidium bromide (EtBr) is a fluorescent dye widely used for staining nucleic acids in agarose and polyacrylamide gels. However, EtBr has several drawbacks, such as its high toxicity and mutagenic capacity, which restricts its use and management. In this study, the use of GelRed®, an alternative dye developed by Biotium, which offers greater sensitivity, safety and stability than EtBr, was evaluated. The performance of both dyes was compared for the staining of DNA amplified by PCR, using the protocols of BCR-ABL, JACK2, ESBL, carbapenemases IMP, VIM, SPM, GIM, NDM, KPC, OXA, mcr-1/mcr-2 and mecca.The results indicated that GelRed® can be used to visualize DNA with a fluorescence intensity equal to or greater than that of EtBr, without the need to modify the extraction, amplification and electrophoresis protocols. Furthermore, GelRed® did not interfere with restriction enzymes and PCR, and does not exhibit mutagenic or cytotoxic effects. It is concluded that GelRed® is a safe and sensitive option compared to EtBr for staining nucleic acids in agarose gels.