El paciente pediátrico con hepatoesplenomegalia febril (HEF) usualmente representa un problema de diagnóstico complejo. Este síndrome puede ser causado por varias patologías, con un espectro de severidad que va desde infecciones autolimitadas sin secuelas importantes hasta enfermedades graves con deterioro rápido y severo al estado general que puede causar la muerte del paciente. Las manifestaciones clínicas diferenciales pueden ser escasas y es importante que el proceso diagnóstico sea organizado racionalmente en el menor tiempo posible, ya que varias de las entidades potencialmente fatales que cursan con HEF tienen buen pronóstico si se tratan tempranamente. En esta revisión proponemos un plan de diagnóstico para HEF en el paciente pediátrico adaptado a países tropicales, enfatizando en algunas patologías infecciosas importantes en esta área geográfica y en su diagnóstico diferencial con otras entidades no infecciosas.