Análisis bioinformático de los reguladores epigenéticos

• Autores: Sergio Lois Olmo
• Directores de la Tesis: Xavier de la Cruz Montserrat (dir. tes.), Josep Lluis Gelpi Buchaca (dir. tes.), Angeles Martínez Balbás (dir. tes.)
• Lectura: En la Universitat de Barcelona ( España ) en 2012
• Idioma: español
• Tribunal Calificador de la Tesis: Marta Cascante Serratosa (presid.), Esteban Ballestar Tarin (secret.), Miguel Angel Peinado Morales (voc.)
• Materias:
  • Matemáticas
    • Ciencia de los ordenadores
      • Informática
  • Química
    • Bioquímica
      • Biología molecular
      • Esteroides
  • Ciencias de la vida
    • Genética
• Enlaces
  • Tesis en acceso abierto en:  TDX  Dipòsit Digital de la UB 
• Resumen

  • En la siguiente tesis se presentan tres estudios centrados en diferentes aspectos estructurales y funcionales de los dominios efectores presentes en los reguladores epigenéticos y sus consecuencias para la interpretación biológica de las modificaciones de las histonas: (i) Propiedades estructurales y patrón de distribución de los dominios de interacción con la cromatina; (ii) La modulación funcional mediante variaciones locales en el centro activo y en la transición desorden-orden experimentada por la cola de las histonas tras su unión a los dominios efectores; y (iii) Los patrones de splicing alternativo de los reguladores epigenéticos y su posible impacto funcional De la caracterización funcional y estructural de los dominios de interacción presentes en las enzimas modificadoras/remodelantes de la cromatina, podemos extraer que existen diferentes factores que afectan la especificidad de dichos dominios hacia una determinada modificación de la histona. Como por ejemplo, la distribución desigual de los dominios de interacción entre las diferentes familias de reguladores epigenéticos, las variabilidades estructural y química globales, y la transición desorden-orden experimentada por la cola de la histona en su unión a los dominios de interacción. Además, la caracterización estructural de los dominios de interacción sugiere diferentes clases en función de características estructurales comunes: flat-groove, narrow-groove y cavity-insertion. En relación a la variabilidad funcional introducida por los eventos de splicing alternativo en las diferentes familias de reguladores epigenéticos estudiadas, podemos extraer que los eventos de splicing tienen una ocurrencia considerable y los cambios introducidos pueden ordenarse en tres categorías: (a) reducciones drásticas de tamaño, (b) cambios en los dominios catalíticos y (c) cambios en los dominios de interacción; a cada una de ellas le corresponde una interpretación funcional que sugiere un efecto regulador importante por parte del splicing alternativo.