Caracterización estructural y funcional de las SSBs de los fagos Nf y GA-1 estudio comparativo con la SSB de 'phi'29
- Autores: Irene Gascón Escobar
- Directores de la Tesis: Margarita Salas Falgueras (dir. tes.)
- Lectura: En la Universidad Autónoma de Madrid ( España ) en 2001
- Idioma: español
- Tribunal Calificador de la Tesis: Joan Ortiz (presid.), José Berenguer Carlos (secret.), Luis Blanco Dávila (voc.), Manuel Serrano Marugán (voc.), Montserrat Elías-Arnanz (voc.)
- Materias:
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- Resumen
Las proteinas SSBs constituyen un gran familia de proteinas cuya propiedad principal es la capacidad para unir DNA de cadena sencilla (ssDNA), desempeñando un papel fundamental en procesos básicos del metabolismo del DNA.
El principal objetivo de esta Tesis fue llevar a cabo un análisis comparativo de las SSBs de los fagos de Baciullos o29, Nf y GA-1 con el fin de intentar establecer una correlación entre caracteristicas estructurales y comportamientos funcionales de estas proteínas.
Las principales conclusiones obtenidas del presente estudio son:
1. La comparación de las secuencias aminoacidicas de las tres SSBs pone de manifiesto el alto grado de homologia existente entre las SSBs de o29 y Nf, y la divergencia de la SSB de GA-1.
2. Las tres SSBs presentan capacidad de union a ssDNA así como de desestabilizacion de helice, aunque se requiere una menor concentracion de la SSB de GA-1 que de las otras dos SSBs para obtener un mismo efecto.
3. Las SSBs de o29 y Nf sedimentan en posición de monómero tras centrifugación en gradientes de glicerol, mientras que la SSB de GA-1 sedimenta en la posición correspondiente a un complejo hexamérico.
4. Los parámetros termodinámicos de unión de las tres SSBs a ssDNA revelan que la SSB de GA-1 ocluye un sitio de unión en el ssDNA mayor que las otras dos SSBs y que su afinidad global por sDNA tambien es mayor.
5. La SSB de GA-1 produce una reducción en la longitud del ssDNA de 6 veces frente a la reducción de 2 veces de la SSB de o29. En ausencia de ssDNA la SSB de GA-1 forma filamentos de proteina de longitud variable, a diferencia de las SSBs de o29 y Nf que no forman estructuras de este tipo.
6. Las tres SSBs manifiestan diferentes comportamientos funcionales en sistemas de replicación de DNA in vitro que reproducen las condiciones de los IR generados in vivo durante la replicacion del DNA viral.
-La SSB de GA-1 estimula la incorporacion de dNTPs por la DNA polimeras
