Resumen de Caracterizacion de card, un factor transcripcional de la bacteria myxococcus xanthus
Myxococcus xanthus, es una bacteria Gram positiva que en ausencia de nutrientes forma cuerpos fructíferos, donde las células se diferencian en mixosporas.
Esta bacteria también responde a la iluminación sintetizando carotenoides. Se ha identificado un gen, carD, que se encuentra implicado en ambos procesos, de manera que una mutación en dicho gen impide a la bacteria fructificar y sintetizar carotenoides. La secuenciación del gen carD revela la presencia de una proteína cuya región carboxi-terminal muestra homología con el dominio de unión a DNA de las proteínas tipo HMGI(Y), siendo la primera vez que se encuentra dicho dominio en un organismo procariótico. La proteína CarD se une in vitro a una secuencia rica en pares A-T requerida para la expresión de un promotor dependiente de CarD.
Utilizando nuevos programas de comparación de secuencia, el extremo amino de CarD muestra homología con el dominio de interacción con la polimerasa de RNA de las proteínas TRCF (proteínas que acoplan el proceso de transcripción al de reparación, aumentando la tasa de reparación en la cadena que se está transcribiendo).
Por otro lado, carD es necesario para que se expresen correctamente los genes que sintetizan dos de las cinco señales intercelulares necesarias para la formación de cuerpos fructíferos, las señales A y C.
Una búsqueda experimental de genes homólogos a carD ha dado resultados positivos sólo en el grupo de las mixobacterias, en concreto con el orden Cystobacterineae al que pertenece Myxococcus xanthus. Se ha clonado el gen homólogo a carD en una bacteria perteneciente a este grupo, Stigmatella aurantiaca. Este gen presenta una secuencia casi idéntica a carD.
