Resumen de Sintesis y estudio estructural del dominio adicional de p41, un miembro de la familia de las tiropinas
Se planteó como objetivo de la presente tesis la obteción por metodos quimicos del modulo Tg del tipo 1 de la forma p41 de la li asociada al MHC de clase II y el estudio estructural de la molecula a nivel tanto de estructura terciaria, empleando tecnicas de resonancia magnetica nuclear.
La sintesis del dominio se ha abordado utilizando una estrategia combinada fase solida/solucion utilizando una quimica Boc/Bzl. Se ha llevado a cabo con éxito tanto la preparación de los fragmentos protegidos como el acoplamiento de los mismos en solución. El péptido completamente protegido se ha sometido a reacciones de desproteccion para obtener el peptido libre con las Cys reducidas. Se han optimizado unas condiciones de oxidacion que permiten obtener mayoritariamente el isómero nativo.
Los estudios por RMN del fragmento p41B han puesto de manifiesto la existencia de más de una conformación aunque se distingue una claramente mayoritoria. La existencia de conformaciones minoritarias se ha atribuido a la isomeria cis-trans de los enlaces Xxx-Pro. La determinación de los elementos de estructura secundaria se ha realizado exclusivamente con los datos correspondientes a la conformacion mayoritaria. Se han empleado los parametros de desplazamiento quimico de los protones a, los coeficientes de temperatura de los protones amida, las constantes de acoplamiento 3 JNHa y los efectos NOEs. El estudio de estos parametros ha permitido determinar la presencia de una hélice a entre los residuos Leu1-lle 11; de una helice B de tres hebras en disposición antiparalela que implica los residuos Tyr35-Pro31,Tyr40-Val44 y Arg57-Thr57-Thr54 y de tres giros formados por los residuos Asp24-Cly27,Gly36-Gly39 y Phe45-Gly48. El analisis computacional ha permitido generar estructuras tridimensionales compatibles con las restricciones derivadas de los datos de RMN.
