Este documento contiene algunos de los lineamientos, que a manera de propuesta y a criterio de los autores, se podrían seguir para la estructuración de un protocolo de investigación en sistemas de salud. Se incluyen como aspectos a desarrollar: el resumen del protocolo, una breve introducción, los antecedentes, justificación y planteamiento del problema, marco conceptual, objetivos, hipótesis o expectativas empíricas, la metodología, consideraciones éticas del estudio propuesto, organización del trabajo, beneficios esperados, referencias bibliográficas y la sección de anexos.
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