Supermatrix analyses reveal the importance of outgroup, gene and taxon sampling in "Onosma" (Boraginaceae) phylogenetics

• Aygören Uluer, Deniz ^[1]
  1. [1] Ahi Evran University

     Ahi Evran University

     Turquía

     
• Localización: Anales del Jardín Botánico de Madrid, ISSN 0211-1322, Vol. 80, Nº 1, 2023
• Idioma: inglés
• Títulos paralelos:
  • Análisis de supermatrices demuestran la importancia del muestreo de grupos externos, genes y taxones en la filogenética de "Onosma" (Boraginaceae)
• Enlaces
  • Texto completo (pdf)
• Resumen
  • español

    La tribu Lithospermeae (Boraginaceae) consta de ca. 26 géneros y 470 especies, en las que Onosma constituye aproximadamente un tercio de las especies (~150). Si bien la tribu ha sido fuertemente apoyada como monofilética, los límites taxonómicos a nivel de género y especie son toda-vía ambiguos. Entre ellos, no solo la posición filogenética de las especies de Onosma de Asia oriental, sino también la delimitación del género son con-fusas. Si Onosma de Asia oriental es monofilético o si el género debe am-pliarse para incluir a Maharanga y tal vez Cystostemon son todavía cues-tiones por resolver. Por estas razones, realicé 16 análisis filogenéticos con diferentes coberturas de taxones, alineamientos, regiones de genes y grupos externos, con hasta 746 taxones de la tribu Lithospermeae y con cinco re-giones de ADN, usando datos de GenBank. Los resultados, con la cobertura taxonómica más amplia hasta la fecha, demuestran que si bien el género Onosma no resultó monofilético en ninguno de los análisis, las relaciones filogenéticas entre Onosma s.s., Onosma de Asia oriental, Maharanga y Cystostemon difieren entre análisis. Sin embargo, el test AU (“approxima-tely unbiased”) mostró que la topología (((Onosma-Asia Oriental+Maha-ranga) Cystostemon) Onosma s.s.) es ampliamente compatible. Por lo tanto, este trabajo destaca la importancia del muestreo de taxones, genes y grupos externos en la filogenética de Onosma.

  • English

    Tribe Lithospermeae (Boraginaceae) consists of ca. 26 gen-era and 470 species, in which Onosma constitutes approximately one third of the species (~150). Although the tribe is strongly supported as monophyletic, both generic and species boundaries remain ambigu-ous. Among them, not only the phylogenetic position of Eastern Asian Onosma species, but also the taxonomic limits of the genus remain unclear. Whether Eastern Asian Onosma is monophyletic, or the genus should be widened to include Maharanga, and maybe Cystostemon, are still open questions. For these reasons, I performed 16 phylogenet-ic analyses with different taxon coverages, alignments, gene regions and outgroups, with up to 746 taxa of tribe Lithospermeae and with five DNA regions, using data from GenBank. The results, with the widest taxon coverage to date, show that while genus Onosma is not monophyletic in any of the analyses, the phylogenetic relationships among Onosma s.s., Eastern Asian Onosma, Maharanga and Cystos-temon differ among analyses. However, the approximately unbiased (AU) test showed that the topology (((Eastern Asian Onosma+Ma-haranga) Cystostemon) Onosma s.s.) is overwhelmingly supported. Therefore, the current study highlights the importance of taxon, gene and outgroup sampling in Onosma phylogenetics.