Influencia del método de desparafinación y el tiempo de almacenamiento en la extracción de DNA a partir de tejidos de archivo

• Autores: Germán Zafra Sierra, Oscar Flórez Vargas, Clara I. González Rugéles
• Localización: Revista Salud Uis, ISSN-e 2145-8464, ISSN 0121-0807, Vol. 36, Nº. 2, 2004, págs. 73-79
• Idioma: español
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    Los tejidos fijados en formalina y embebidos en parafina son un material de incalculable valor para estudios retrospectivos que requieran aplicar el análisis molecular a muestras clínicas de archivo. Sin embargo, la extracción del DNA a partir de este material consume mucho tiempo y los reactivos usados pueden contribuir a su fragmentación y contaminación, dificultando de esta forma su uso para pruebas moleculares. En este trabajo se analizaron cuatro métodos de desparafinación y su efecto sobre la cantidady calidad del DNA. Todos los métodos mostraron una alta fragmentación del DNA, con amplificación de fragmentos de tamaños menores a 200 pb. El método de microondas fue el único que permitió amplificación de fragmentos de mayor tamaño, además de presentar la ventaja de su simplicidad, poco tiempo de ejecución y bajo costo. El tiempo de almacenamiento influyó, obteniéndose amplificación en muestras de 6 años y no en muestras almacenadas por 10 años.

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    Formaline-fixed and paraffin wax embedded tissues are an invaluable source for retrospectives molecular analysis with clinicalcorrelation. However, DNA extraction from this type of material demands a prolonged time and the DNA is often highlyfragmented and contaminated by protein agents, making it inadequate for molecular purposes. Four methods to deparaffinizationare tested and compared the quality and quantity to DNA obtained. All techniques lead to DNA degradation but only shortsequences can be amplified, less than 200 bases in all methods. The most efficient method uses a microwave to melt the wax. Thismethod was quick, straighforward, cheaper and effective to amplify fragments the 450 pb. The time of storage influenced, withamplification to specimens of 6 years and not in samples stored 10 years.