Resumen de Assessing genetic diversity of venezuelan elite rice lines using morpho-agronomic and molecular markers

Marco Antonio Acevedo Barona, Iris Pérez Almeida, Sandy Molina, Darío Torrealba, Carlos Marín R.

• español

  La base genética del arroz cultivado bajo riego en Venezuela, y en América Latina es limitada por lo que el Proyecto Nacional para Mejoramiento Genético del Arroz (PNMGA) ha aplicado estrategias para aumentarla. El objetivo de este trabajo fue caracterizar la diversidad genética de 13 líneas de elite de arroz de riego del PNMGA y cuatro variedades testigo de importancia económica mediante marcadores morfo-agronómicos y moleculares, así como determinar su asociación mediante la prueba de Mantel. Se plantaron 17 genotipos en un ensayo durante el ciclo de riego 2014 en el campo experimental del INIA-Guárico utilizando un diseño de bloques completos al azar con tres repeticiones, en una parcela de 20 m2 con un manejo similar al de los productores. Se evaluaron trece caracteres cuantitativos y se encontró una alta variabilidad entre los genotipos. El análisis de componentes principales mostró que cuatro atributos agrupan 71 % de la varianza fenotípica total. El análisis UPGMA para ambos tipos de marcadores usando distancia Euclidiana y Dice permitió discriminar los 17 genotipos en cinco y cuatro grupos, respectivamente, mostrando que el análisis molecular fue más preciso e informativo. El análisis factorial de correspondencias múltiples indicó que los marcadores ISSR 880, 834 y 850 discriminaron los 17 genotipos, y la prueba de Mantel detectó una correlación baja entre las matrices de distancia. Ambos análisis contribuyen para caracterizar la diversidad genética en el germoplasma de arroz irrigado.

• English

  The genetic base of irrigated rice in Venezuela, and Latin America, is narrow and the Venezuelan National Project for the Improvement of Genetic Rice (PNMGA) has applied strategies to increase it. The objective of this work was to characterize the genetic diversity of 13 irrigated elite rice lines and four check varieties of economic importance, by means of morpho-agronomical and molecular markers, as well as to determine their association using the Mantel test. A total of 17 genotypes were planted on a trial during the 2014 irrigated cycle in the experimental field of the National Agricultural Research Institute (INIA)-Guárico using a completely randomized block design with three replicates, in a 20 m2-plot with standard agronomical management. Thirteen quantitative characters were evaluated and high variability among genotypes was found. Principal Components Analysis (PCA) showed that four attributes comprised 71 % of the total phenotypic variance. The UPGMA conglomerates analysis for both types of markers using Euclidean and Dice distance allowed the discrimination of the 17 genotypes in five and four groups, respectively, showing that the molecular analysis was more accurate and informative. The multiple correspondence factor analysis indicated that ISSR 880, 834 and 850 markers discriminated the 17 genotypes, and the Mantel test detected a low correlation between distance matrices. Both analyzes contribute to characterize genetic diversity in irrigated rice germplasm.