Resumen de Estimación de la similitud genética entre cultivares locales y mejorados de caraota (Phaseolus vulgaris L.) usando marcadores microsatélites

Oralys C. León Brito, Catalina Ramis, Ángela María Bedoya

• español

  La base de los programas de fitomejoramiento son poblaciones variables creadas por el cruce entre progenitores divergentes. Los datos de similitud genética estimados a partir de marcadores moleculares pueden ser usados para seleccionar tales genotipos parentales. El objetivo del presente trabajo fue estimar la similitud genética entre cultivares locales y mejorados de caraota usando 20 marcadores microsatélites (SSR). Se evaluaron 30 genotipos: 12 cultivares locales y 18 mejorados. Se identificaron los alelos por locus, se calculó el porcentaje de frecuencias alélicas y se determinó el contenido de información polimórfica (PIC). Con el registro de la presencia (1) y ausencia (0) de bandas, se obtuvo una matriz binaria, utilizada para el análisis de similitud por el método UPGMA. Paralelamente, se realizó un análisis de coordenadas principales. De los 20 SSR utilizados 16 resultaron polimórficos, lo que permitió discriminar la similitud entre los cultivares. El PIC promedio de la población global y los diferentes tipos de cultivares evaluados presentaron poco polimorfismo genético entre los 30 cultivares, demostrando que la base genética de la caraota es estrecha. Con el análisis de similaridad se conformaron 6 grupos de cultivares, destacándose los locales I-2363 e I- 2294 que integraron un solo grupo. El resto de los genotipos se organizaron en su mayoría por grupos de cultivares locales, comerciales y líneas avanzadas. La variación entre los cultivares fue similar, aunque existe una variabilidad distinta a los cultivares comerciales de uso actual que puede ser aprovechada en los programas de mejoramiento genético del cultivo.

• English

  The base of the breeding programs are variable populations created by the crossing between divergent parents. Genetic similarity data estimated from molecular markers can be used to select such parental genotypes. The objective of the present work was to estimate the genetic similarity between landraces and improved cultivars of common bean using microsatellite markers (SSR). Thirty genotypes were evaluated: 12 landrace and 18 improved. The alleles were identified by locus, the percentage of allelic frequencies was calculated and polymorphic information content (PIC) was determined. With the recording of the presence (1) and absence (0) of bands, a binary matrix was obtained, used for the analysis of similarity by the UPGMA method. In parallel, a principal coordinate analysis was carried out. Of the 20 SSR used, 16 were polymorphic, which allowed to discriminate the similarity between the cultivars. The average PIC of the global population and the different types of cultivars evaluated showed little genetic polymorphism among the 30 cultivars, demonstrating that the genetic base of the common bean is narrow. The analysis of similarity allowed the conformation of 6 groups of cultivars, standing out the premises I-2363 and I-2294 that integrated a single group. The rest of the genotypes were organized mostly by groups of landrace, commercial and advanced lines. The variation between the cultivars was similar, although there is a variability different to the commercial cultivars of current use that can be exploited in the breeding programs of the crop.