Implicaciones funcionales de los polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) en genes codificantes de proteínas y no codificantes en enfermedades multifactoriales

• Autores: Julián Ramírez Bello, Mayra Jiménez Morales
• Localización: Gaceta médica de México, ISSN 0016-3813, Vol. 153, Nº. 2, 2017, págs. 238-250
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Functional implications of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in protein-coding and non-coding RNA genes in multifactorial diseases
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    Los SNP representan las variantes genéticas más comunes del genoma humano. Estas alteraciones de un solo nucleótido, localizadas tanto en genes codificantes como en no codificantes de proteínas, se dividen en neutras y funcionales. Las primeras no tienen impacto biológico, mientras, las segundas afectan diversos procesos y constantemente se asocian con riesgo en enfermedades multifactoriales. Los SNP funcionales de los promotores de ambos tipos de genes, denominados SNP reguladores (rSNP) y rSNP de microRNA (miR-rSNP), respectivamente, afectan la expresión génica. Los SNP funcionales ubicados en la estructura del RNA heterogéneo nuclear (exones e intrones), mRNA maduros (5’ UTR, secuencia codificante y 3’ UTR), y miRNA (pri, pre y miRNA maduros), se denominan SNP RNA estructurales (srSNP) y miR-srSNPs, respectivamente. Los primeros afectan el corte y empalme; los segundos, la traducción, la estabilidad, la secuencia de aminoácidos, la estructura y la función de las proteínas, y la interacción de mRNA/miRNA; y los terceros alteran la estructura, el procesamiento, la interacción miRNA/mRNA y su función. La evaluación del efecto biológico-funcional alélico de los SNP ha contribuido enormemente a un mejor entendimiento de las enfermedades multifactoriales. El objetivo de esta revisión es actualizar al lector acerca del efecto funcional de estas variantes localizadas en algunos genes codificantes y no codificantes de proteínas, y su relación con las enfermedades multifactoriales.

  • English

    Single nucleotide polymorphisms (SNPs) represent the most common type of variation in the human genome. The SNPs located in protein-coding and non-coding RNA genes are classified as neutral and functional. The neutral have no effect, while the functional affect different biological processes and continually confer risk for multifactorial diseases. Functional SNPs found in the promoters of protein-coding and non-coding RNA genes (microRNAs: miRNAs) termed regulatory SNP (rSNPs) and miRNAs rSNPs (miR-rSNPs), respectively, affect the gene expression. Functional SNPs located on the structure of the precursor mRNAs (exons and introns), mature mRNA (5´ untranslated region [UTR], coding sequence, and 3´ UTR), and primary, precursor, and mature miRNAs are termed structural RNA SNPs (srSNPs) and miR-srSNPs, respectively. The srSNPs affect the splicing (and alternative splicing), srSNPs affect the splicing (and alternative splicing), the translation, stability, amino acid sequence, structure, and function of proteins and interaction between mRNA/miRNAs. Finally, the miR-srSNPs affect the structure, processing and interaction between miRNAs/mRNAs. Functional characterization of potentially harmful risk alleles of the SNPs located in protein-coding and non-coding RNA genes have contributed to an understanding of their functions in the complex diseases. The objective of this review is update the reader on the functional role of the SNPs located in protein-coding and non-coding RNA genes and their relationship with multifactorial diseases.