En la actualidad, la puesta en el mercado de productos fertilizantes elaborados con microorganismos no cuenta con una regulación armonizada a nivel de toda la Unión Europea, sino que cada estado miembro ha desarrollado su propio marco legislativo. En el caso de España, el Real Decreto 506/2013, de 28 de junio, sobre productos fertilizantes, incluye, desde diciembre de 2017, estos productos fertilizantes entre los tipos del Anexo I.
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