Study of bubble length size and distribution in double-stranded DNA

• Marta Marty-Roda ^{[1] [1]} ; Santiago Cuesta-López ^{[1] [1]} ; Titus S. van Erp ^[2]
  1. [1] Universidad de Burgos

     Universidad de Burgos

     Burgos, España

     
  2. [2] Norwegian University of Science and Technology

     Norwegian University of Science and Technology

     Noruega

     
• Localización: III Jornadas de Doctorandos de la Universidad de Burgos: Universidad de Burgos, 15 y 16 de diciembre de 2016 / coord. por José Luis Cuesta Gómez; Joaquín A. Pacheco Bonrostro (dir.), 2016, ISBN 978-84-16283-30-9, págs. 265-269
• Idioma: inglés
• Texto completo no disponible (Saber más ...)
• Resumen
  • español

    Hemos aplicado una adaptación del modelo Peyrard-Bishop-Dauxois (PBD) para estudiar la distribución y el tamaño de burbujas en DNA de doble cadena, Se muestra la distribución de burbujas para secuencias con contenido de guanina—citosina (GC) variable y se obtubieron mediante simulaciones de dinámica molecular.

  • English

    We applied an adaptation of the PBD model to study bubble length distribution in double-stranded DNA. The distribution of bubbles is presented for segments of varying guanineicytosine (GC) content and was obtained with molecular dynamics simulations.