Phenotypic and molecular characterization of clinical isolates of bipolaris, curvularia, exserohilum and pithomyces

Author

Da Cunha, Keith

Director

Gené Díaz, Josepa

Codirector

Cano Lira, José Francisco

Guarro Artigas, Josep

Date of defense

2014-05-16

Legal Deposit

T 1479-2014

Pages

239 p.



Department/Institute

Universitat Rovira i Virgili. Departament de Medicina i Cirurgia

Abstract

The generaBipolaris, Curvularia, Exserohilium and Pithomyceshave species clinically relevant.However, their identification is not easy. A total of 281 clinical isolates of Bipolaris,Curvularia,ExserohilumandPithomyceshave been studied by morphological and molecular methods. The in vitrosusceptibility studies of these genera were performed against the different antifungal drugs availables. Our studies revealed the presence of many species of Bipolaris, Curvularia and Pithomyces species can be isolated from human specimens; we proposed five new species ofCurvularia such as C. americana, C. chlamydospora, C. hominis, C. muehlenbeckiae and C. pseudolunata.Our phylogenetic analysis revealed that only E. rostratum should be considered as human opportunist. Evaluation of the in vitro antifungal susceptibility profile revealed that most of the antifungal drugs tested presented a good activity against the genera studied.


Bipolaris, Curvularia, Exserohilumand Pithomycesson agentes responsables de infecciones oportunistas.El gran número y lasemejanza morfológicaentre las especies en estos géneros dificultan su identificación. Se han estudiadoun total de 281 cepasde Bipolaris, Curvularia, Exserohilum y Pithomyces por métodos morfológicos y moleculares además dela susceptibilidad in vitro de los mismo frente alos antifúngicos. Los resultados obtenidos demuestran la presencialas siguientes especies:Bipolariscynodontis, B. micropus, B. setariae, Curvulariaaeria, C. borreriae, C. intermedia, C. protuberata, C. pseudorobusta,C. sorghina, Pithomycessacchariy P. maydicus,por primera vez en muestras clínicas, además de las 5 nuevas especies de Curvularia. Nuestro análisis filogenético ha demostrado que del género Exserohilum sólo E. rostratum debe de ser considerada como un patógenooportunista. Laevaluación del patrón de susceptibilidad antifúngicaha evidenciado que la mayoría de antifúngicosensayados presentan una buena actividad frente a las distintas especies estudiadas.

Keywords

Taxonomia; Filogenia; Hongos de interes clínico

Subjects

579 - Microbiology

Documents

tesi.pdf

12.73Mb

 

Rights

ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.

This item appears in the following Collection(s)