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Medidas de similitud novedosas en Quimioinformática

  • Autores: Oscar Miguel Rivera Borroto
  • Directores de la Tesis: Yiovani Marrero Ponce (dir. tes.), Ricardo del Corazón Grau Ábalo (dir. tes.), J. M. García de la Vega (dir. tes.)
  • Lectura: En la Universidad Autónoma de Madrid ( España ) en 2014
  • Idioma: español
  • Tribunal Calificador de la Tesis: Miguel Katrib Mora (presid.), Vivian del Rosario Sistachs Vega (secret.), Yoanna María Álvarez Ginarte (voc.), Luis Alberto Montero Cabrera (voc.), Marta Lourdes Baguer Diaz Romañach (voc.)
  • UNESCO :
    • 32 Ciencias medicas
      • 3208 Farmacodinámica
        • 320801 Absorción de medicamentos
        • 320802 Acción de los medicamentos
  • Enlaces
  • Resumen
    • En esta tesis se introducen nuevas medidas cuantitativas de similitud que se integran a algoritmos de cribado virtual de conjuntos de datos quimioinformáticos representados por descriptores moleculares informativos y relevantes. En el trabajo desarrollado se fundamenta la aplicación de la disimilitud de Ruzicka y se compara con las medidas clásicas de similitud reportadas en la literatura especializada. Paralelamente, se introducen en Quimioinformática tres nuevos algoritmos de agrupamiento, mostrando una efectividad comparable al de referencia de Ward. Posteriormente, se realiza un estudio sobre tendencia al agrupamiento de repositorios de la especialidad y se estudia la relación entre separabilidad de los datos y el desempeño de clasificadores sobre dichos datos; se fundamenta de este modo la aplicación del índice de Dunn del Análisis Visual de Datos como medida de clusterabilidad. Además se prueban nueve medidas de la Teoría Estadística de las Mediciones para búsquedas de similitud en Quimioinformática. Estas medidas mejoran de forma general a las existentes actualmente, incluyendo al coeficiente de elección de Tanimoto. Por último, se deducen relaciones de orden parcial entre algunas medidas bivariadas y se extiende al caso de múltiples objetos biomoleculares. Como aplicación, a la Quimioinformática, de todas estas nuevas siete medidas de similitud multivariadas se analizan relaciones de semejanza entre múltiples entidades biomolecular con potencialidades para la obtención de nuevos fármacos. Los resultados obtenidos demuestran la viabilidad de los nuevos desarrollos para el uso de la similitud en el diseño teórico de productos químicos de interés farmacológico.


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