Resumen de Funciones adicionales del genoma viral en el ensamblaje y estabilidad de la cápsida de virus RNA
La visión de los virus como un contenedor proteico, la cápsida, que protege el genoma viral es inadecuada. Mientras que la cápsida es un complejo macromolecular dinámico implicado en múltiples etapas del ciclo viral, el genoma no sólo es el cargo con la información genética, sino que también participa en otras funciones indispensables para la viabilidad de las siguientes generaciones de virus. En este trabajo hemos analizado las estructuras por crio-microscopía electrónica del rinovirus humano B-14 (HRV-B14), un virus RNA de cadena sencilla (ssRNA), y del virus del hongo Penicillium chrysogenum (PcV), un virus RNA de cadena doble (dsRNA). El virión de HRV-B14, resuelto a 2.9 Å de resolución, está formado por una cápsida icosaédrica (~30 nm de diámetro) con un número de triangulación T=1 (P=3), constituida por 4 proteínas, VP1, VP2, VP3 y VP4. El ssRNA genómico se encuentra parcialmente organizado (~12%) en segmentos de dsRNA de14 pb en los ejes de simetría icosaédrica de orden 2, formando una caja dodecaédrica interna que contribuye a la estabilidad del virión mediante numerosas interacciones. Específicamente, las bases de los extremos del dsRNA están desapareadas e interaccionan con el Trp38 de VP2, y la Lys52 de VP2 interacciona en la interfaz entre el dsRNA y la cápsida; VP1 interacciona con el dsRNA con los aa Ser22, Lys13, Lys26 y Lys30. La cápsida vacía de HRV-B14, resuelta a 3.8 Å de resolución, está expandida un ~3% y presenta poros en forma de Z de distinto tamaño alrededor de los ejes de simetría icosaédrica de orden 2. Mientras que la localización del genoma en el virión está relacionada con su mecanismo de liberación posterior, donde interviene activamente la Lys52, la apertura asincrónica de los poros sugiere una salida preferencial del ssRNA viral por uno de ellos hacia el citoplasma de la célula huésped. El chrysovirus PcV se ha resuelto a 2.14 Å de resolución. La cápsida T=1, de ~40 nm de diámetro, está constituida por 60 copias de un heterodímero de las versiones maduras de las proteínas P2 y P4, ambas procesadas en su región C-terminal. P2 y P4 tienen un plegamiento similar, compartido con las proteínas de la cápsida de otros micovirus dsRNA como totivirus y quadrivirus. El ~60% del genoma se dispone como una capa de filamentos de dsRNA, de ~20 Å de diámetro y separados entre si ~35 Å, en estrecho contacto con la superficie interna de la cápsida, donde las cargas negativas y positivas están representadas de manera similar. P4, en 18 (de 20) ejes de simetría icosaédrica de orden tres, está implicada en la organización del dsRNA genómico. Las cápsidas vacías de PcV, resueltas a 2.3 Å de resolución, indican cambios conformacionales en los ejes de orden 3 y tienen una menor rigidez mecánica que las cápsidas llenas
