Chromatin reorganization during epithelial-to-mesenchymal transition

• Autores: Laura Pascual Reguant
• Directores de la Tesis: Sandra Peiro Sales (dir. tes.)
• Lectura: En la Universitat Pompeu Fabra ( España ) en 2018
• Idioma: español
• Tribunal Calificador de la Tesis: Ferran Azorín Marín (presid.), Luciano Di Croce (secret.), Marcus Buschbeck (voc.)
• Programa de doctorado: Programa de Doctorado en Biomedicina por la Universidad Pompeu Fabra
• Materias:
  • Ciencias de la vida
    • Biología celular
    • Biología molecular
• Enlaces
  • Tesis en acceso abierto en: TDX
• Resumen

  • Las laminas nucleares (A/C y B) son los mayores constituentes de la lamina nuclear (NL). Los estructuralmente conservados dominios asociados a las laminas (LADs) están formados por regiones genómicas que contactan con la NL. Aún así, las laminas también se han encontrado en el interior de nucleo, pero el papel que ejercen estan laminas aún está por definir. En esta tesis, hemos mapado la localización de la Lamina B1 en todo el genoma de ratón utilizando una fraccion enriquecida en eucromatina y hemos seguido su dinamismo durante la transición epitelio-mesénquima (EMT). La Lamina B1 se asocia con eucromatina activamente expressada y abierta, formando dominios de eucromatina associados a la Lamina B1 (eLADs) dinámicos con un tamaño medio de 0.3Mb. Los datos obtenidos por Hi-C relacionan los eLADs con la organización tridimensional del genoma de ratón durante el proceso de transición epitelio-mesénquima y correlaciona el enriquecimiento de la Lamina B1 en las fronteras de dominios de associación topológica (TADs) con un incremento en la fuerza de estas fronteras. Niveles reducidos de la Lamina B1 alteran la EMT y comprometen la adquisición de características mesenquimales. Por tanto, el genoma de ratón necesita la presencia de dominios plásticos y dinámicos (eLADs) que contengan niveles predeterminados de Lamina B1 para poder completar la EMT.